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PCR檢測試劑盒擴(kuò)增產(chǎn)物分析方法剖析

時間:2024/9/29閱讀:114
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PCR檢測試劑盒PCR擴(kuò)增DNA片段只是一個重要手段。擴(kuò)增片段的檢測和分析才是目的,根據(jù)研究對象和目的的不同而采用不同的分析法。瓊脂糖凝膠電泳可幫助判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的大小,有助于擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定,點(diǎn)雜交除可鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物外,還有助于產(chǎn)物的分型;Southern雜交分析可從非特異擴(kuò)增產(chǎn)物中鑒定出特異產(chǎn)物的大小,增加檢測的特異性與敏感性,最近發(fā)展的一系列產(chǎn)物分析法(PCR-ELISA,PCR-EIA,PCR-OLA等)均有助于產(chǎn)物的精確分析。PCR檢測試劑盒擴(kuò)增產(chǎn)物分析方法剖析如下:

一、凝膠電泳分析法

PCR產(chǎn)物可通過瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,以前者常用,通過電泳可以判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的大小。在臨床檢測中,僅通過凝膠電泳判斷擴(kuò)增片段大小即可滿足檢測的需要。通常制膠方法為100mlTBE加1.5g瓊脂糖在微波鍋內(nèi)溶解,稍冷后倒入電泳槽。

電泳后,用溴化乙淀染色20min,然后用去離子水漂洗2次,每次15min,于UV燈下觀察結(jié)果并拍照。

凝膠電泳不僅可以鑒定產(chǎn)物的大小,檢測擴(kuò)增的情況,還可以用來純化擴(kuò)增產(chǎn)物。

二、點(diǎn)雜交

當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物是多條帶時,用點(diǎn)雜交更合適。這種方法的基本過程是,首先將擴(kuò)增的DNA固定到尼龍膜或硝酸纖維素濾膜上,再用放射性或非放射性標(biāo)記物標(biāo)記的探針雜交。點(diǎn)雜交還有助于檢測突變DNA的突變類型,用于人類遺傳病診斷和某些基因的分型。放射性同位素32P標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測的敏感性、特異性和方法的可靠性均不容懷疑,對人們認(rèn)識某些疾病與基因變異的關(guān)系起了很大的作用。但是,由于同位素不穩(wěn)定和放射性危害,不能常規(guī)用于臨床或法醫(yī)檢驗(yàn),用非放射性物質(zhì)標(biāo)記的寡核苷酸探針分析PCR產(chǎn)物以確定核酸序列變異則是一種簡便而安全的方法。非放射性標(biāo)記物質(zhì)穩(wěn)定性高,使用方便、安全、檢測速度快。

三、微孔板夾心雜交法

該法是通過一固定于微孔板的捕獲探針與PCR產(chǎn)物的某一區(qū)域特異雜交使產(chǎn)物間接地固定于微孔板上。然后,再用一生物su 等非放射性標(biāo)記物標(biāo)記的檢測探針與產(chǎn)物的另一區(qū)域雜交,漂洗后顯色即可判斷結(jié)果,該法需要兩個雜交過程來檢測一個產(chǎn)物,因此,其特異性較一次雜交的檢測法高。該法已用于HBV的檢測,其敏感度可達(dá)5個HBv DNA分子。此法的敏感性和特異性與PCR 32P探針的Southern雜交法相當(dāng)。但PCR微孔板夾心雜交法操作簡便、快速、避免了同位素標(biāo)記探針的危害,顯色反應(yīng)類似于臨床常規(guī)應(yīng)用的ELISA,適于臨床實(shí)驗(yàn)室常規(guī)應(yīng)用。

四、PCR-ELISA法

本法避免了電泳和雜交的步驟,適于常規(guī)ELISA記數(shù)儀檢測。因?yàn)?'端修飾后仍可進(jìn)行常規(guī)PCR擴(kuò)增特異靶序列。因此,可以通過修飾一個引物的5′端使其攜帶便于PCR產(chǎn)物固定的功能基因,而通過另一引物5′-端的修飾使產(chǎn)物便于檢測。

 

 

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