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上海永葉生物科技有限公司

中國科學(xué)家Science完成大型基因組項(xiàng)目

時(shí)間:2014-12-12閱讀:313
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由深圳華大基因,哥本哈根大學(xué),武漢大學(xué)生科院,中科院等多國科研機(jī)構(gòu)參與的一項(xiàng)大型基因組研究項(xiàng)目12月在*期刊Science雜志上公布了成果。
這一項(xiàng)目歷時(shí)四年多,完成了45種鳥類的基因組測序,并由此構(gòu)建了迄今為止zui完備的鳥類進(jìn)化樹,相關(guān)研究共發(fā)布了23篇文章,其中8篇將在Science雜志同期刊發(fā),另外15項(xiàng)成果將在Genome Biology以及GigaScience等雜志上發(fā)表。
這項(xiàng)研究涉及20個(gè)不同國家的約80個(gè)機(jī)構(gòu)的數(shù)百名科學(xué)家參與,分析了每種主要鳥類種系中至少一種主要品種,由此揭示出了現(xiàn)代鳥類是如何在一個(gè)物種大滅絕事件(大約6600萬年前,消滅了所有的恐龍)之后快速出現(xiàn)的。
鳥綱是地球上品種zui豐富的有四肢的脊椎動(dòng)物,此次構(gòu)建的進(jìn)化樹揭示了一些zui早的鳥類是如何歧化的,回答了許多*存在的、有關(guān)鳥類、鱷魚類和恐龍的問題,并闡釋了鳥類性染色體的演化、鳥類與人類的發(fā)聲學(xué)習(xí)以及導(dǎo)致鳥類失去其牙齒的過程。 
而且由于近年來禽流感疫情的盛行,這項(xiàng)研究成果也將有助于分析鳥類攜帶病毒,以及傳播路線等問題。
在其中“Comparative genomics reveals insights into avian genome evolution and adaptation”這篇旗艦論文中,華大基因的王俊,張建國(Guojie Zhang,音譯)等人比較分析了48個(gè)鳥類基因組,其中包括研究人員完成的基因組序列:烏鴉、鴨、鴿子、隼、啄木鳥、鷹和鴕鳥等,還有之前已經(jīng)完成是3個(gè)基因組序列:雞、火雞和斑馬雀。
這一發(fā)現(xiàn)將有助于揭示為什么鳥類基因組總體上比哺乳動(dòng)物基因組要小約70%,而且研究人員還指出了保留達(dá)1億年以上的鳥類基因組的特別區(qū)域,以及在這一過程中,某些鳥類特征的趨同演化。
文章作者之一,霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所的Erich D. Jarvis表示,“過去,人們一直在用1到2個(gè)(zui多10或20個(gè)基因),來嘗試分析在過去1億年左右,鳥類物種間的相互關(guān)系。而我們的理論是:如果你采用整個(gè)基因組,那么你會(huì)獲得比只有1或2個(gè)基因所能提供的譜系相比,更為的物種譜系。”

他們發(fā)現(xiàn)鳥類的W染色體與人類的Y染色體不同,前者還存在許多活躍的基因,不同鳥類物種的性染色體目前正處于不同的演化階段。 
除此之外,在一篇綜述類文章中,中科院的徐星等人介紹了近期追蹤鳥類足跡的新成果,尤其是中國東北部地區(qū)羽毛恐龍化石的發(fā)現(xiàn),徐星等人將目前發(fā)育生物學(xué),功能解剖學(xué),以及古生物學(xué)記錄整合在一起,提出了一些新觀點(diǎn)。

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