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[方法]
1.用無菌塑料吸嘴挑取一個AmpR噬菌粒菌落(直徑大約lmm)并將其轉入到0.2ml MicroAmp反應管中, 內含20u1洗脫緩沖液。在GeneAmp9600 PCR儀中,95℃加熱樣本10分鐘(避免用離心澄清,因為加熱可使細胞碎片黏附在管底)。
2.將菌落提取物作為該克隆的主拷貝保存。另外,這些菌落也可以直接轉移到PCR反應體系中,并在PCR程序中插入加熱步驟。此時,可將克隆主拷貝穿刺接種到在用UV滅菌并鋪有LB—瓊脂培養(yǎng)基+Amp的微板孔中。
3.配置PCR反應體系:將3ul菌落提取物加入到一個0.2ml MicroAmpTM反應管中;反應管包含150nmol/L正鏈引物和反鏈引物、50mmol/L dNTP、0.5%NP-40、Taq緩沖液和1ul AmpllTag DNA聚合酶,終體積為50ul。按以下程序運行PCR反應:94℃10秒、60℃10秒、72℃10秒,共循環(huán)30次。
4.在SilentMonitor膜底微板的各孔中,裝入Sephacril“S-300的水性懸液,使每孔中含有400ul穩(wěn)定床體積介質。用真空過濾器在板底形成真空狀態(tài),
5.吸取各個克隆PCR擴增產(chǎn)物并加入到含有已抽干的Sephacril孔中。真空抽吸收集96孔板中的濾液(PCR擴增模板的大小決定了采用何種凝膠過濾介質:我們發(fā)現(xiàn),Sephacril S-300對分離我們的300bpPCR擴增片段效果*。按照上述流程,無論樣本的處理或收集均比使用商業(yè)供應的裝入微量離心管的旋轉柱更加容易和快速,還節(jié)省材料成本)。
6.用已純化的PCR產(chǎn)物,按照標準實驗方案進行測序。
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