微生物載體保存法是將微生物吸附在適當載體上進行干燥保存的方法，常用的有以下幾種方法:

1. 土壤保存法

主要用于能形成孢子或孢囊的微生物菌種的保藏。方法是在滅菌的土壤中加入菌液，立即在室溫下進行干燥或使菌體繁殖后再干燥，然后冷藏或在室溫下密封保存。保存用的土壤原則上以肥沃的耕土為宜，土壤需風干、粉碎、過篩和滅菌。

使微生物在土壤中繁殖后進行干燥保存的方法是:取適量土壤(5克)置于塞有棉塞的試管中，加水或加入充分稀釋的液體培養(yǎng)基(以含水量為土壤最大持水量的60%為宜)，然后高壓滅菌。再將需保存的微生物進行大量接種，培養(yǎng)至菌絲能用肉眼確認的程度為止，移入干燥器中經短時間干燥或風干后密封，冷藏或室溫保存。

2.砂土保存法

取清潔的砂，過60目篩去掉大砂粒，并用磁鐵吸去砂中鐵屑，再用NaOH溶液、10% HCl溶液和水交替清洗數次，干燥后，置于試管或安瓶管中保持2~3cm深，再經干熱滅菌后，加入1ml菌種培養(yǎng)液，經充分混勻后，放入真空干燥器中，*干燥后熔封保存。也可用二份洗凈的砂(經HCl預處理)和一份貧瘠、過篩的黃土攙和后滅菌，再進行菌種保藏。

3.硅膠保存法

以6~16目的無色硅膠代替砂子，干熱滅菌后，加入菌液。加菌液時，由于硅膠的吸附熱常使溫度升高，因而需設法加以冷卻。

4.磁珠保存法

將菌液浸入素燒磁珠(或多孔玻璃珠)后再進行干燥保存的一種方法。在螺旋口試管中裝入1/2管高的硅膠(或無水CaSO4)，上鋪玻璃棉，再放上10~20粒磁珠，經干熱滅菌后，接入菌懸液，最后冷藏、室溫保藏或減壓干燥后密封保藏。本法對酵母菌很有效，特別適用于根瘤菌，可保存長達兩年半時間。

5.麩皮保存法

在麩皮內加入60%的水，經滅菌后接種培養(yǎng)，最后干燥保藏。

6.紙片(濾紙)保存法

將滅菌紙片浸入培養(yǎng)液或菌懸液中，常壓或減壓干燥后，置于裝有干燥劑的容器內進行保存。

寄主保存法

微生物侵入其寄主后加以保存的方法。

冷凍保存法

適用于抗凍力強的微生物。這些微生物可在其菌體細胞外遭受凍結的情況下而不受損傷，而對其它大多數微生物而言，無論在細胞外凍結還是在細胞內凍結，都會對菌體造成損傷。