厭氧氨氧化工藝是一種脫氮工藝，其zui大氮負荷可達9.5 kg · m-3 · d-1，且處理污水成本只需0.75C =· kg-1，因此厭氧氨氧化是一種前景的生物處理工藝.但由于厭氧氨氧化至今未能獲得純培養(yǎng)，為了得到高純度的AAOB，目前只能用密度梯度離心的方法獲得純度為99.8%的AAOB，因此對AAOB的研究仍受到很大的阻礙，這意味著對厭氧氨氧化工藝的應用及推廣也會帶來諸多難題.然而“在單個細胞水平上對基因組進行測序”的單細胞測序技術(shù)能夠解決上述難題.因此對AAOB的進一步了解有賴于單細胞測序技術(shù)的成熟應用.

　　3 AAOB與其他微生物之間的關(guān)系

　　在自然生態(tài)系統(tǒng)和人工生態(tài)系統(tǒng)中，AAOB不僅與環(huán)境有著密切的關(guān)系，而且與其他微生物也有著密切的關(guān)系.微生物之間的關(guān)系有種內(nèi)和種間關(guān)系.其中AAOB的種內(nèi)關(guān)系主要體現(xiàn)在群體感應系統(tǒng)，而AAOB的種間關(guān)系主要是與氨氧化菌、亞硝酸鹽氧化菌、反硝化菌、厭氧甲烷氧化菌的合作與競爭關(guān)系.

　　3.1 AAOB的種內(nèi)關(guān)系(群體感應系統(tǒng))

　　群體感應作為一種通訊機制在微生物細胞之間普遍存在，它能夠根據(jù)菌群密度和周圍環(huán)境的變化來調(diào)節(jié)基因表達，從而控制菌群行為.由于AAOB 至今未能得到純培物，所以對AAOB 群體感應的深入研究無從下手. 但根據(jù)目前對AAOB的研究來看，Ding等(Ding et al.，2013)認為有3個現(xiàn)象可以推測厭氧氨氧化菌之間存在群體感應系統(tǒng).

　　(1)厭氧氨氧化活性存在密度依賴性.根據(jù)Strous等的研究發(fā)現(xiàn)，只有當AAOB細胞濃度大于1010～1011 cell · mL-1時，AAOB才具有厭氧氨氧化活性.

　　(2)目前認為AAOB屬于革蘭氏陰性細菌，而對于革蘭氏陰性細菌的群體感應系統(tǒng)而言其自誘導物為N-乙酰化高*內(nèi)酯(N-acyl-homoserine lactones，AHLs)類化合物，主要用作種內(nèi)“語言”，且對于革蘭氏陰性菌中AHLs的合成來說，S-腺苷*(S- adenosyl methionine，SAM)和乙?；d體蛋白(acyl-acyl carrier protein，acyl-ACP)是必要的生物分子.Strous等利用宏基因組學技術(shù)對C and idatus Kuenenia stuttgartiensis 的脂肪酸代謝基因組學信息進行了研究，發(fā)現(xiàn)其具有編碼SAM和acyl-ACP的合成酶的相關(guān)基因，證明其具有自誘導物合成潛力.

　　(3)De Clippeleir 等在研究長鏈高*內(nèi)酯對OLAND生物膜中厭氧氨氧化速率的影響時發(fā)現(xiàn)，在OLAND生物膜系統(tǒng) 中，添加N-十二?；?內(nèi)酯(N-dodecanoyl homoserine lactone，C12-HSL)可以增強AAOB活性，而對AOB沒有影響.C12-HSL屬于AHLs中碳鏈較長的一種，其對革蘭氏陰性細菌的自誘導起到關(guān)鍵的作用.

　　3.2 AAOB的種間關(guān)系 3.2.1 AAOB的種間競爭關(guān)系

　　目前已發(fā)現(xiàn)的AAOB有5屬17種，根據(jù)目前對AAOB的研究來說，除了用AAOB處理垃圾滲濾液的研究中發(fā)現(xiàn)C and idatus Scalindua brodae和C and idatus Scalindua wagneri有等量共存的現(xiàn)象，絕大多數(shù)情況下很少能發(fā)現(xiàn)兩種AAOB在相同單一生境中等量共存的現(xiàn)象，這意味著AAOB的確存在種間的競爭關(guān)系.不論在自然生態(tài)系統(tǒng)還是人工生態(tài)系統(tǒng)C and idatus Brocadia和C and idatus Kuenenia都zui為常見，現(xiàn)以該兩種菌屬為例討論AAOB的種間競爭關(guān)系.