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《Nature Methods》盤點(diǎn)2011年度技術(shù),選出了zui受關(guān)注的技術(shù)成果:人工核酸酶介導(dǎo)的基因組編輯(genome editing with engineered nucleases)技術(shù)。
除了基因組編輯以外,《Nature Methods》也整理出了2011年zui值得關(guān)注的幾項(xiàng)技術(shù),分別為:?jiǎn)渭?xì)胞技術(shù)(Single-cell methods)、功能基因組資源(Functional genomic resources)、糖蛋白組學(xué)(Glycoproteomics)、單倍體因果突變(Causal mutations in a haploid landscape)、單層光生物成像(Imaging life with thin sheets of light)、非模式生物(Non–model organisms)、光基礎(chǔ)電生理學(xué)(Light-based electrophysiology)和RNA結(jié)構(gòu)(RNA structures )。
其中單細(xì)胞或者單分子之類的技術(shù)幾乎每年都會(huì)出現(xiàn)在Nature Methods的這一名單中,比如去年的單分子結(jié)構(gòu)分析技術(shù)(Single-molecule structure determination)。所謂單細(xì)胞技術(shù)很好理解,就是相對(duì)于群體細(xì)胞研究,針對(duì)單個(gè)細(xì)胞的研究技術(shù),由于培養(yǎng)基或者機(jī)體中的細(xì)胞存在多樣性,或者說是異質(zhì)性,這為許多實(shí)驗(yàn)分析造成了障礙??梢哉f,隨著現(xiàn)代生物學(xué)的發(fā)展,“平均值”這個(gè)詞已經(jīng)不能滿足我們的需要了,我們要了解細(xì)胞之間的差異性。
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然而要進(jìn)行單細(xì)胞分析也困難重重,從技術(shù)上說也存在幾個(gè)方面的問題。首先無論是針對(duì)一個(gè)特異性大分子,還是在OMIC水平上進(jìn)行分子分析,都存在單細(xì)胞提取物數(shù)量少,難以分析的困難,這甚至可以說是不可能完成的,因此增加靈敏度勢(shì)在必行。
除此之外高通量分析也是一個(gè)瓶頸,要想獲得單細(xì)胞分析確切的分析結(jié)果,研究人員必須快速而準(zhǔn)確的分析多個(gè)細(xì)胞,這并不容易。另外單細(xì)胞分析也常常需要進(jìn)行多種方式分析,這不僅是由于細(xì)胞存在于一種異質(zhì)性環(huán)境匯總,而且也在同一時(shí)間,也需要測(cè)量多個(gè)參數(shù)。
不過值得慶幸的是,今年在這些方面都不斷有好消息傳出,比如質(zhì)譜流式細(xì)胞分析技術(shù),這種技術(shù)采用了同位素作為抗體標(biāo)記,替代熒光探針,從而延伸了流式細(xì)胞儀的多元分析能力。這篇題為“Single-Cell Mass Cytometry of Differential Immune and Drug Responses Across a Human Hematopoietic Continuum”的文章由多倫多大學(xué)和斯坦福大學(xué)完成,他們采用同位素標(biāo)記抗體,結(jié)合質(zhì)譜分析的方法實(shí)現(xiàn)了同時(shí)對(duì)細(xì)胞表面多達(dá)一百種標(biāo)記物的檢測(cè)。
通常采用的熒光抗體標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)的方法,雖然能實(shí)現(xiàn)細(xì)胞分選,但只能夠同時(shí)識(shí)別6-10種不同顏色的熒光,且還需盡量避免發(fā)生熒光重疊。而這項(xiàng)研究通過這個(gè)可以稱為大量細(xì)胞計(jì)數(shù)法的方法,觀察了人類骨髓產(chǎn)生的不同形態(tài)細(xì)胞中及表面的34種物質(zhì),不但能正確歸類10多種不同類型的免疫細(xì)胞,還能觀察到各類免疫細(xì)胞的內(nèi)部變化,從而預(yù)知可能發(fā)生的變化。這將有助于更快更廣泛的測(cè)量處方藥對(duì)人體細(xì)胞的反應(yīng)及功效,提前發(fā)現(xiàn)細(xì)胞病變,研發(fā)出針對(duì)個(gè)人的治療藥物。
另外在基因表達(dá)分析研究中,數(shù)字逆轉(zhuǎn)錄酶PCR(digital reverse-transcriptase,生物通譯)技術(shù),結(jié)合微流體設(shè)備也幫助實(shí)現(xiàn)同時(shí)監(jiān)控上百個(gè)單細(xì)胞中上百個(gè)基因的表達(dá)。今年的一項(xiàng)研究證明了這一點(diǎn):Single-cell dissection of transcriptional heterogeneity in human colon tumors。這項(xiàng)有關(guān)腫瘤異質(zhì)性的研究利用新技術(shù)對(duì)數(shù)百個(gè)結(jié)腸癌細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞基因表達(dá)分析,由此獲得了人類結(jié)腸癌異質(zhì)性圖譜。
隨著單細(xì)胞分析技術(shù)越來越多的用于解答生物問題,對(duì)于靈敏度和高通量的要求也在不斷增加,尤其是在大分子分析方面——這比DNA和RNA分析的需求更多,而且商業(yè)用途的需求也越來越多。
來源:生物通
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