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Nature年度技術(shù):基因組編輯

時(shí)間:2011-12-31閱讀:373
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時(shí)近歲末,各大雜志接連進(jìn)行了年終盤點(diǎn),上周出版的《Nature》雜志也對2011年進(jìn)行了回顧:365 days: Nature's 10 ,評點(diǎn)了2011年的科技進(jìn)展,科技政策以及重要人物。其中《Nature Methods》也盤點(diǎn)了年度技術(shù),選出了2011年zui受關(guān)注的技術(shù)成果:人工核酸酶介導(dǎo)的基因組編輯(genome editing with engineered nucleases)技術(shù)。

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方法技術(shù)從來都是科學(xué)進(jìn)步的推動(dòng)力,在生命科學(xué)領(lǐng)域更是如此,去年《Nature Methods》將這一殊榮頒給了光遺傳學(xué)(optogenetic),原因是專家們認(rèn)為這一技術(shù)工具在神經(jīng)科學(xué),以及細(xì)胞生物學(xué)信號通路研究方面具有革命性的促進(jìn)作用。而今年《Nature Methods》將年度技術(shù)頒給了基因組編輯技術(shù),理由是認(rèn)為這種技術(shù)能通過在某些物種基因組中進(jìn)行靶向特異性的突變,從而解答并提出更多的生物學(xué)問題。
也許了解一個(gè)基因或者蛋白的功能zui可靠的方法就是特異性干擾其作用,并監(jiān)控帶來的影響,這種逆向遺傳學(xué)分析方法目前已經(jīng)在許多物種中成為了常規(guī)性方法,但是還是存在一些例外,某些物種很難,甚至可以說是不可能完成內(nèi)源性基因位點(diǎn)的靶向突變,要達(dá)到這一目的,就必需采用一些更為間接的方法:對應(yīng)的異源位置修改基因的過量表達(dá),或者敲除這一基因(常常進(jìn)行部分敲除),比如RNA干擾技術(shù)。

而人工鋅指核酸酶介導(dǎo)的基因組編輯技術(shù),或者稱為基因組定點(diǎn)修飾技術(shù),則不同,這種技術(shù)原則上能在任何物種基因組的任何位置上進(jìn)行設(shè)計(jì)切除,從而能在內(nèi)源性序列上引入特異性修改。
從技術(shù)發(fā)展的角度來看,實(shí)際上人工核酸酶技術(shù)已經(jīng)成為了在多種細(xì)胞類型和生物體內(nèi)進(jìn)行、位點(diǎn)特異性的基因修飾的一個(gè)常用工具。這種酶包括有三個(gè)主要的類型——鋅指核酸酶 (ZFN),轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(transcription activator-like effector ucleases,TALENs),以及歸巢核酸內(nèi)切酶(engineered meganucleases),這些技術(shù)都建立在非?;A(chǔ)的研究之上,比如利用ZFN進(jìn)行物種內(nèi)源性基因修改,就用到了三方面的知識(shí):限制性內(nèi)切酶的作用機(jī)理,細(xì)胞如何修復(fù)DNA缺口,以及DNA結(jié)合蛋白如何在如此多基因組序列中特異性定位。
這些技術(shù)也毫無疑問能用于臨床上,比如糾正單基因決定的人類疾病中錯(cuò)誤突變等。今年在這方面就獲得了重要進(jìn)展——來自費(fèi)城兒童醫(yī)院等處的研究人員研究人員,利用遺傳工程改造后的ZFNs,在基因組上特定位置誘導(dǎo)雙鏈斷裂,并且在實(shí)驗(yàn)小鼠活體中以具有臨床意義的水平刺激基因組編輯,從而誘導(dǎo)的基因修正。
這種方法利用了鋅指核酸酶*在染色體上定位的優(yōu)勢,避免了傳統(tǒng)基因療法存在插入誘變(insertional mutagenesis)的風(fēng)險(xiǎn),取得了基因組編輯在基因療法上的突破。

這是臨床上基因組編輯技術(shù)2011年取得的一大突破,而在技術(shù)進(jìn)展方面,今年TALENs也獲得了新成果——雖然ZFNs是*的工具,但是很難設(shè)計(jì),因此難以實(shí)際操作。而今年在植物病原菌TAL效應(yīng)子方面的成果促進(jìn)了基因組編輯技術(shù)向前邁開了一大步,這項(xiàng)研究表明TAL效應(yīng)子能顯著簡化DNA綁定代碼,從而減輕了一些目前存在的,工程改造工具中的問題。
除此之外,令人高興的是可以看到商業(yè)用途ZFNs的價(jià)格降低了,比如今年Sigma宣布調(diào)整了CompoZr 鋅指核酸酶(ZFN)產(chǎn)品的價(jià)格——CompoZr ZFN 產(chǎn)品全線降價(jià)50%。(咨詢CompoZr ZFN 產(chǎn)品具體技術(shù)資料和價(jià)格>> >>),而且一些產(chǎn)品能組合工具,幫助研究人員定制所需的核酸酶。同時(shí)TALENs以及歸巢核酸內(nèi)切酶也有了商品化產(chǎn)品。到底哪種技術(shù)zui終將取勝,目前還不得而知,畢竟還存在許多未知數(shù),尤其是一些物種中TALEN的功能。

來源:生物通

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