基因組測序法可對疫情暴發(fā)進(jìn)行追蹤

【資料簡介】

基因組測序法可對疫情暴發(fā)進(jìn)行追蹤
研究者利用全基因組測序已經(jīng)追查到去年在歐洲大范圍致病的大腸桿菌（E.coli）暴發(fā)路徑。這是*個采用基因組測序的方法來研究食源性暴發(fā)的動態(tài)，由此為了解未來疫情和傳染病的出現(xiàn)和蔓延提供了新途徑。
利用全基因組測序已經(jīng)追查到去年在歐洲大范圍致病的大腸桿菌（E.coli）暴發(fā)路徑。

這是*個采用基因組測序的方法來研究食源性暴發(fā)的動態(tài)，由此為了解未來疫情和傳染病的出現(xiàn)和蔓延提供了新途徑。這項研究的合作者還包括法國巴斯德研究所、丹麥國立血清研究所等。

在生物學(xué)中，一個生物體的基因組是指包含在該生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遺傳信息。確定哪些DNA變異導(dǎo)致特定性狀或疾病則需要進(jìn)行個體間比較。該研究的主要作者、傳染性疾病動態(tài)中心研究者永納坦·格拉德說，尋找疫情暴發(fā)的多種細(xì)菌的基因組之間的差異，即可得到疫情發(fā)生的線索。像做偵探工作一樣，研究人員通過這種方式跟蹤疫情，可了解未來疾病暴發(fā)路徑。

去年夏天在德國，因大腸桿菌病毒的肆虐成千上萬人生病，50多人死亡，之后在法國也引起了小范圍的暴發(fā)。研究人員將這兩國的致病大腸桿菌株對比分析，發(fā)現(xiàn)菌株相同。然而，利用全基因組測序分析菌株之間的差異時，研究人員發(fā)現(xiàn)：所有與德國當(dāng)?shù)叵嚓P(guān)暴發(fā)的菌株都幾乎是相同的，而出現(xiàn)在法國菌株表現(xiàn)出更大的多樣性，顯示出是從德國菌株分離出來的一個子集。

隨著基因組測序成本的下降，未來將其與傳統(tǒng)的流行病學(xué)方法相結(jié)合，可以為人們對傳染病的出現(xiàn)及蔓延提供更深入的了解，將有助于指導(dǎo)公共衛(wèi)生預(yù)防措施。基因組測序法可對疫情暴發(fā)進(jìn)行追蹤