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滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)試劑盒說(shuō)明書(shū)
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滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)試劑盒說(shuō)明書(shū)
滾環(huán)擴(kuò)增(rolling circle amplification,RCA)是近幾年發(fā)展起來(lái)的一種核酸恒溫?cái)U(kuò)增方法。以環(huán)狀 DNA 為模板,通過(guò)一個(gè)短的 DNA 引物(與部分環(huán)狀模板互補(bǔ)),在 phi29 DNA 聚合酶催化下將 dNTPs 轉(zhuǎn)變成單鏈 DNA,此單鏈 DNA 包含成百上千個(gè)重復(fù)的模板互補(bǔ)片段。這種方法不僅可以直接擴(kuò)增 DNA 和 RNA,還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)靶核酸的信號(hào)放大,靈敏度達(dá)到一個(gè)拷貝的核酸分子,因此在核酸檢測(cè)中具有很大的應(yīng)用價(jià)值和潛力。因其高靈敏度、高特異性和可操作性,RCA 技術(shù)在基礎(chǔ)研究、實(shí)際檢測(cè)、醫(yī)療診斷及納米材料等方面都有很好的應(yīng)用,結(jié)合細(xì)胞原位檢測(cè)、單核苷酸多態(tài)性 SNPs, 蛋白質(zhì)分析、免疫芯片和全基因組的擴(kuò)增等研究都能發(fā)揮其巨大的優(yōu)勢(shì)。本試劑盒配備的 phi29 DNA 聚合酶具有鏈置換和連續(xù)合成特性,可連續(xù)合成長(zhǎng)達(dá) 70kb 的 DNA 片段。另外,該酶具有 3’→5’外切酶校讀功能,合成的 DNA 片段保真性高。試劑盒配備的 Random Hexamers 為 6 堿基隨機(jī)引物可對(duì)目標(biāo)分子進(jìn)行指數(shù)放大(通常放大 10000 倍)。
滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)試劑盒說(shuō)明書(shū)RCA 的原理圖如下:
滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)試劑盒說(shuō)明書(shū)本產(chǎn)品具有下列特點(diǎn):
即開(kāi)即用,十分簡(jiǎn)單方便,用戶(hù)不需要單獨(dú)準(zhǔn)備各成分。配方經(jīng)過(guò)精心優(yōu)化,長(zhǎng)模板可以達(dá) 70kb。
高保真酶,所得 DNA 突變率低
本試劑盒可以進(jìn)行 50 次 20uL 體系的 RCA 實(shí)驗(yàn)。
1. 純化帶有靶片段的環(huán)狀 DNA 或長(zhǎng)度在 10kb 以上的線狀 DNA,將其準(zhǔn)確定量并稀釋到 2pg/uL。注意:堿變性法提取的質(zhì)粒 DNA 都有殘留的 RNA 污染,盡管電泳時(shí)看不見(jiàn),但測(cè) OD 時(shí)這些 RNA 會(huì)使得 DNA 濃度虛高。因此質(zhì)粒 DNA 需要電泳時(shí)跟濃度已知的 DNA marker 比較來(lái)確定濃度。此方法誤差在 2 倍之內(nèi),但可以接受。
2. 在 PCR 塑料管中加入不超過(guò) 5 uL 純化好的模板 DNA,用量在 50pg 左右。如果體積不足 5uL,則用自備的超純水補(bǔ)齊。同時(shí)做一個(gè)不加模板 DNA 模板的陰性對(duì)照。
3. 加入等體積(2.5uL)變性液,輕柔吹打混勻。
4. 室溫放置 2 分鐘。
5. 加入 2.5uL RCA 溶液 A。此時(shí)樣品總體積為 10uL。
6. 在 10uL 樣品中,加入 10 uL 的 RCA 溶液 B,輕柔吹打混合均勻。
7. 加入 1 uL phi 29 DNA 聚合酶(10U/uL),輕柔吹打混合均勻。
8. 30℃保溫 24 小時(shí)。注意:反應(yīng)時(shí)間不要短于 24 小時(shí)。使用 PCR 儀進(jìn)行 30℃ 保溫并打開(kāi)熱蓋保溫。如果采用 30℃水浴,在樣品管中加入 30-50uL 石蠟油以防水分蒸發(fā),因?yàn)?nbsp;30℃長(zhǎng)時(shí)間的水浴也能使水分蒸發(fā)到管壁,從而改變反應(yīng)體系中各成分的濃度、降低 RCA 反應(yīng)效率。
9. 65℃保溫 10 分鐘使 phi29 DNA 聚合酶滅活。注:由于 phi29 DNA 聚合酶有 DNA
外切活性,所以將其滅活以免干擾后續(xù)反應(yīng)。
10. 立即取 5uL RCA 反應(yīng)液進(jìn)行電泳檢測(cè)擴(kuò)增效果,DNA 片段大小將在 10kb 以上, 可達(dá) 70kb。
11. 擴(kuò)增的 DNA 可以用于后續(xù)試驗(yàn)或電泳檢測(cè)。換一下
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