美科學(xué)家確定一種人類蛋白進(jìn)化細(xì)節(jié)
人類腎上腺皮質(zhì)激素受體蛋白在4.5億年的時(shí)間里發(fā)生結(jié)構(gòu)變化,zui終進(jìn)化出了特定的功能。
美國(guó)科學(xué)家進(jìn)行的一項(xiàng)研究確定了一種重要人類蛋白——腎上腺皮質(zhì)激素受體(GR)的遠(yuǎn)古原子結(jié)構(gòu),并且揭示出它在4.5億年歷史中的進(jìn)化細(xì)節(jié)。這項(xiàng)的研究有助于澄清以來(lái)科學(xué)家在進(jìn)化遺傳學(xué)上的一些爭(zhēng)論。相關(guān)論文日前在線發(fā)表于《科學(xué)》雜志上。
論文作者、美國(guó)俄勒岡大學(xué)的Joseph Thornton表示:“我們從來(lái)沒(méi)有看得如此清楚、如此遠(yuǎn)。新的研究讓我們從原子水平看清了進(jìn)化塑造分子機(jī)器的機(jī)制,并推測(cè)出了這一歷史進(jìn)化事件的順序過(guò)程。”
在的研究中,Thornton和博士后Jamie Bridgham利用強(qiáng)大的計(jì)算和分子技術(shù),重建了GR蛋白的遠(yuǎn)古祖先。隨后,他們與北卡羅萊納大學(xué)的生物化學(xué)家Eric Ortlund和Matthew Redinbo一道,利用美國(guó)Argonne國(guó)家實(shí)驗(yàn)室先進(jìn)光子源的超高能X射線,繪制了遠(yuǎn)古蛋白當(dāng)中2000個(gè)原子的位置圖。在此基礎(chǔ)上,研究人員追溯研究了過(guò)去4.5億年里,該蛋白的原子架構(gòu)是經(jīng)過(guò)怎樣改變,從而進(jìn)化出現(xiàn)今的特殊功能——讓細(xì)胞能夠響應(yīng)。
通過(guò)分析原子結(jié)構(gòu),研究人員發(fā)現(xiàn),在幾億年的時(shí)間里,遠(yuǎn)古GR蛋白共發(fā)生了7次較大的變異。同時(shí),科學(xué)家認(rèn)為,GR蛋白如果要對(duì)產(chǎn)生響應(yīng),則在幾次主要變異之前,都必須發(fā)生一些相對(duì)較小甚至可以忽略的“自由變異”。在這種關(guān)聯(lián)的基礎(chǔ)上,研究人員zui終推測(cè)出了GR蛋白所有基因變異的順序。
研究結(jié)果表明,GR蛋白所發(fā)生的zui根本的變異是使蛋白的某一區(qū)域整體發(fā)生了重新裝配,從而使一部分原子接近。而這一區(qū)域發(fā)生的另一個(gè)重要變異創(chuàng)建了原子與新的緊密相互作用。值得注意的是,在這兩個(gè)過(guò)程之前,GR蛋白發(fā)生了許多“自由變異”,這從結(jié)構(gòu)上支撐了GR蛋白的特定部分,使其能夠承受zui終的改變。
Thornton表示,這些自由變異*是碰巧發(fā)生的事情,但如果不是它們首先發(fā)生,之后的較大變異就不會(huì)是一條通向GR蛋白新功能的進(jìn)化之路。要是幾億年的過(guò)程重新來(lái)過(guò),現(xiàn)在出現(xiàn)的很可能就是*不同的基因序列和蛋白功能機(jī)制。
NSF項(xiàng)目主任Dianna Padilla評(píng)價(jià)說(shuō):“該研究成果是許多科學(xué)家的夢(mèng)想,它解答了一個(gè)十分重要的問(wèn)題,即適應(yīng)性是通過(guò)較大的還是較小的變異發(fā)生的。新的研究結(jié)果說(shuō)明,小的變異才能使較大的適應(yīng)性發(fā)生并且得到改善。”