1.PCR技術(shù)
PolymeraseChainReaction聚合酶鏈反應(yīng)
它是一種模擬天然DNA復(fù)制過程,在有DNA模板、dna聚合酶(Taq酶)、RNA引物和四種dNTP的情況下,通過高溫變性(90℃-95℃,1-2min),低溫退火(25℃-37℃,1-2min),中溫延伸(60℃-75℃,90sec-5min),這樣反復(fù)循環(huán)的過程中,在體外擴(kuò)增特異性DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。
1)、pcr反應(yīng)成分:
taqDNA聚合酶
引物濃度:一般0.1-0.5μmol/L
dNTP:一般為50-200μmol/L
Mg2+
模板:PCR對模板的要求不高,單、雙鏈DNA均可,但樣品中不能混有蛋白酶、核酸酶、DNA聚合酶抑制劑以及能與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì)。
添加劑:DMSO(二甲基亞楓),提高擴(kuò)增效率及特異性
(1)理論上PCR合成產(chǎn)物的數(shù)量經(jīng)過每輪循環(huán)都將增加一倍,應(yīng)按2n的指數(shù)方式遞增,PCR反應(yīng)30輪循環(huán)后,PCR擴(kuò)增應(yīng)達(dá)到230個拷貝,約109個拷貝。但由于DNA聚合酶的質(zhì)量、待擴(kuò)增片段的序列及反應(yīng)系統(tǒng)的條件等各種因素的影響,實際擴(kuò)增效率比預(yù)期的要低,一般可達(dá)106-107個拷貝
平臺效應(yīng)”:PCR反應(yīng)中,當(dāng)引物-模板與DNA聚合酶達(dá)到一定比值時,DNA聚合酶催化反應(yīng)趨于飽和,即PCR反應(yīng)不再增加。平臺效應(yīng)在PCR反應(yīng)中是不可避免的,但一般在平臺效應(yīng)出現(xiàn)前,PCR產(chǎn)物的數(shù)量足以滿足實驗的需要。
(2)PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化
PCR方法操作簡便,但影響因素頗多,因此需要根據(jù)不同的DNA模板,摸索zui適條件。主要從:
反應(yīng)的特異性、敏感性、真實性、擴(kuò)增效率等四個方面衡量PCR反應(yīng)的結(jié)果。
①循環(huán)參數(shù) 變性 退火 延伸
②PCR反應(yīng)成分
(3)PCR反應(yīng)引物的設(shè)計
引物的設(shè)計在整個PCR擴(kuò)增中占有十分重要的地位。