1.如果誘餌蛋白對(duì)酵母細(xì)胞是有毒的，該怎么辦？

在某些情況下，在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)不好的菌珠可以在固體培養(yǎng)基上生長(zhǎng)得很好。首先重懸克隆于1ml的SD/–Trp，接著將重懸液平鋪于5 個(gè)100-mm的SD/–Trp平板，在30℃下溫浴，直至平板上的克隆相互粘在一起。用5ml 0.5X YPDA刮下每塊板上的克隆，并收集到一管中，這樣就可以使用這個(gè)細(xì)胞重懸液進(jìn)行正常的雜交反應(yīng)。

2.如果誘餌蛋白能直接激活報(bào)告基因的表達(dá)，該如何處理？

該蛋白很可能有轉(zhuǎn)錄激活域，是個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。可以通過(guò)基因重組切掉轉(zhuǎn)錄激活域，然后重新檢測(cè)其是否自激活，但要注意重組也有可能破壞蛋白之間的互作。

3.轉(zhuǎn)化效率太低怎么辦？

可以采用以下方法解決：

1)檢測(cè)一下DNA的純度，如果可以的話，重新用乙醇純化。

2)DNA-BD/誘餌蛋白很可能是有毒的。

3)不適當(dāng)?shù)呐囵B(yǎng)基，重新配制培養(yǎng)基，并做對(duì)照轉(zhuǎn)化。

4)檢測(cè)pGBT9對(duì)照載體的轉(zhuǎn)化效率，放置于SD/–Trp平板上，轉(zhuǎn)化效率應(yīng)該在1 x10⁵ colonies/mg DNA以上。

4.雜交效率不高，該如何處理？

在雜交中，預(yù)轉(zhuǎn)化的誘餌細(xì)胞的數(shù)量可能不夠。當(dāng)對(duì)誘餌菌株進(jìn)行液體培養(yǎng)過(guò)夜時(shí)，應(yīng)挑選大的、新鮮的克隆進(jìn)行培養(yǎng)，經(jīng)過(guò)離心和重懸后，再使用血球計(jì)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。密度應(yīng)該在1 x10⁹/ml。

一個(gè)甚至兩個(gè)融合蛋白對(duì)酵母細(xì)胞有毒。你可以通過(guò)重組方法來(lái)減輕毒性，同時(shí)又能保證蛋白的相互作用?；蛘呤褂帽磉_(dá)水平較低的載體。也可以在瓊脂平板或?yàn)V膜上進(jìn)行雜交。但同時(shí)必須作雜交對(duì)照實(shí)驗(yàn)。