在線發(fā)表于《自然—方法學(xué)》上的兩項(xiàng)相關(guān)研究對(duì)比了用于分析從單個(gè)細(xì)胞所有RNA獲得的測序數(shù)據(jù)的不同計(jì)算工具。生物體內(nèi)每個(gè)細(xì)胞的DNA是相同的，但不同種類細(xì)胞間的轉(zhuǎn)錄為RNA的部分基因組卻有所差別。這種差別在很大程度上影響細(xì)胞產(chǎn)生不同功能，所以弄清楚這種差別很重要。
　　單個(gè)細(xì)胞所有RNA集合（被稱為轉(zhuǎn)錄組）的高通量測序采用的是一種名為RNA-seq的方法，該測序手段對(duì)了解許多基因功能起著一定作用，但是，從75個(gè)短堿基對(duì)序列片段中重建整個(gè)長度可達(dá)數(shù)千堿基對(duì)的轉(zhuǎn)錄體則需要更*的計(jì)算工具。
　　Paul Bertone等人對(duì)比了用于轉(zhuǎn)錄體分析的20多種的計(jì)算手段，并用來執(zhí)行RNA-seq分析過程的兩個(gè)重要步驟：*項(xiàng)研究探討了哪種方法將序列片段標(biāo)記到參考基因組上，另一項(xiàng)研究側(cè)重于重建被標(biāo)記序列的轉(zhuǎn)錄體所需要的方法，這兩項(xiàng)研究均強(qiáng)調(diào)了現(xiàn)有計(jì)算方法的優(yōu)勢，也提出了缺點(diǎn)和需要改進(jìn)之處。大多數(shù)轉(zhuǎn)錄重建方法能很好地執(zhí)行一些操作比如轉(zhuǎn)錄的部分重組，但所有的方法都無法重組整個(gè)RNA。此次研究為今后校準(zhǔn)方法的研發(fā)提供了有用的衡量標(biāo)準(zhǔn)。