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基因測(cè)序全面揭示乙肝病毒整合機(jī)制

時(shí)間:2012-5-31閱讀:673
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  5月28日,由香港大學(xué)、新加坡國(guó)立大學(xué)、深圳華大基因研究院、亞洲癌癥研究組織ACRG(由禮來(lái)公司、默克公司和輝瑞公司創(chuàng)建)共同完成的乙型肝炎病毒(簡(jiǎn)稱乙肝病毒,HBV)整合機(jī)制研究成果(Genome-wide Survey of Recurrent HBV Integration in Hepatocellular Carcinoma)于雜志《自然—遺傳學(xué)》(Nature Genetics)上在線發(fā)表。該研究從全基因組水平上構(gòu)建了一個(gè)高精度無(wú)偏差的乙肝病毒整合(HBV Integration)圖譜,揭示了潛在的乙肝病毒整合機(jī)制,為肝癌的早期診斷、治療及靶向藥物研發(fā)等提供了非常寶貴的資源。
 
肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)(以下簡(jiǎn)稱為肝癌)是目前常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,*每年約有100萬(wàn)人死于肝癌。我國(guó)肝癌發(fā)病率居世界,且肝癌死亡率很高,已成為我國(guó)第2大癌癥殺手。乙肝病毒的基因可以整合入肝細(xì)胞基因組中,故稱之為乙肝病毒整合。目前,乙肝病毒整合被認(rèn)為在肝癌發(fā)生過(guò)程中具有重要作用。許多研究人員已在此方面展開大量的研究,但由于技術(shù)和臨床樣本數(shù)量的限制,嚴(yán)重阻礙了相關(guān)研究的進(jìn)一步開展。
 
在本研究中,科研人員分別對(duì)來(lái)自81例HBV陽(yáng)性患者和7例HBV陰性患者的癌組織樣本和癌旁組織樣本進(jìn)行了全基因組測(cè)序及分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)HBV整合在肝癌中是一種普遍現(xiàn)象,HBV整合頻率在癌組織中(86.4%)明顯高于癌旁組織(30.7%)。結(jié)合轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析后,研究人員發(fā)現(xiàn)了3個(gè)新的HBV整合位點(diǎn)(CCNE1, SENP5, ROCK1),并推測(cè)這些基因可能在癌癥的發(fā)生過(guò)程中起著非常重要的作用。
 
基于本研究成果,研究人員對(duì)潛在的HBV整合規(guī)律及其致癌機(jī)制進(jìn)行了推測(cè)。他們發(fā)現(xiàn)HBV整合所具有的某些特征有助于病毒控制被感染的宿主基因,如HBV整合位點(diǎn)的偏向性以及HBV整合位點(diǎn)拷貝數(shù)目變異(CNV)增加等,這些變化將會(huì)影響染色體的穩(wěn)定性及引起基因表達(dá)的改變。此外,研究還發(fā)現(xiàn)HBV整合與患者的臨床表現(xiàn)密切相關(guān)。發(fā)生HBV整合的患者會(huì)更早地發(fā)展成為肝細(xì)胞癌而且*更低。因此,通過(guò)對(duì)HBV整合的干預(yù)治療可能有助于防止癌癥的惡化,延長(zhǎng)病人的生命。
 
華大基因該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人鄭漢城表示:“這是從全基因組水平上探索肝癌患者中的HBV整合的分子機(jī)制。我們獲得的數(shù)據(jù)和研究結(jié)果將使科研人員更加深入地了解HBV的致癌原因??紤]到目前不太理想的臨床治療效果,我們認(rèn)為應(yīng)該充分重視高危人群的疫苗接種預(yù)防,并考慮從HBV整合干預(yù)治療的角度制定臨床治療策略,從而有效阻止病人癌癥的惡化延長(zhǎng)病人的生命。”
 
該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、香港大學(xué)榮譽(yù)副教授、新加坡國(guó)立大學(xué)的Ken Sung博士說(shuō):“該研究成果將為進(jìn)一步深入研究HBV整合在促進(jìn)肝癌發(fā)展和影響臨床治療中的作用機(jī)制提供了新的思路,我希望我們的下一步研究工作能夠進(jìn)一步有助于提高肝癌的診斷和預(yù)防。”
 
ACRG董事會(huì)董事、禮來(lái)公司腫瘤轉(zhuǎn)化科學(xué)總監(jiān)Christoph Reinhard博士說(shuō):“我們?cè)谳^大的癌癥患者群體中所發(fā)現(xiàn)的腫瘤分子特征,對(duì)開發(fā)更加具有針對(duì)性和有效的藥物具有十分重要的科研價(jià)值。ACRG的建立就是希望通過(guò)非競(jìng)爭(zhēng)性合作,加快對(duì)亞洲zui常見(jiàn)的癌癥的研究,本研究成果也證實(shí)了團(tuán)結(jié)合作的重要性。”

來(lái)源:EurekAlert中文

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