一直以來，科學家們都認為癌癥是細胞水平上的單個克隆疾病，從進化上來說，就是所謂的“成功”腫瘤細胞，就是能將其遺傳模板傳遞給下一代的腫瘤細胞。癌細胞包含能快速擴散的惡性克隆，也就是說，這些是在生長腫瘤的宿主環(huán)境中zui適生長的克隆，分析這些克隆能有助于了解為什么癌癥如此頑固，難以治療，以及它們是如何在毒性療法中存活下來的。

單細胞測序方法即single cell sequencing（SNS），能準確定量一個單細胞核中基因拷貝數(shù)目。由于癌細胞中基因組部分被刪除，或者擴增，從而引起關(guān)鍵基因的缺失，或者表達過量，干擾正常細胞生長，因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目，從而診斷癌癥。
近年來這一研究領(lǐng)域成為了癌癥研究的熱點之一，3月2日出版的Cell雜志就以“Single-Cell Sequencing of Cancer”為題，介紹了本期中兩項單個癌細胞全外顯子測序的研究成果，這兩項成果分別是針對血液癌癥，和固體腎臟腫瘤展開的研究。

據(jù)介紹，在*篇“Single-Cell Exome Sequencing and Monoclonal Evolution of a JAK2-Negative Myeloproliferative Neoplasm”文章中，中國深圳華大基因研究院的研究人員，聯(lián)合西南大學，武漢大學等處的研究人員對取自一例典型的JAK2陰性ET病人的90個單細胞進行了全外顯子測序，通過諸多分析，研究人員揭示了此ET在腫瘤發(fā)生中遵循單克隆演化模型，并鑒定了一些與ET的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的突變基因。
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第二篇文章“Single-Cell Exome Sequencing Reveals Single-Nucleotide Mutation Characteristics of a Kidney Tumor”則采用了一種新方法，對腎透明細胞癌進行了研究。他們發(fā)現(xiàn)此例腎癌并非由常見的兩個突變基因VHL和PBRM1導(dǎo)致，這說明在病人群體中所鑒定的頻發(fā)突變（recurrent mutation）可能與腫瘤個體無關(guān)，同時也強調(diào)了在癌癥分析和診斷過程中進行個性化治療的重要性。
通過遺傳學定量分析，研究人員發(fā)現(xiàn)在此腎癌中不存在明顯的克隆（細胞）亞群，而且在腫瘤細胞群體內(nèi)不同細胞突變頻率的突變之間也存在差異明顯的堿基突變譜，研究人員推測這可能與腫瘤演化過程中的選擇緊密相關(guān)。此外，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些與此腎癌發(fā)生相關(guān)的重要功能基因。

去年冷泉港實驗室，德州大學MD Anderson癌癥研究中心的研究人員采用了一種稱為染色體斷點分析（chromosomal breakpoint analysis）的方法，來分析不同腫瘤細胞亞群之間的。但這一方法的局限是不能從單個核苷酸水平了解單個癌細胞的遺傳特性。
而研究則建立了一種基于多重置換擴增（MDA）的單細胞測序新方法，并對該方法的擴增均一性、靈敏度、特異性等方面進行了全面評估。這種將多重置換擴增（MDA）和測序技術(shù)相結(jié)合的單細胞測序方法不僅具有更高的分辨率和基因組覆蓋度，而且具有更好的敏感性和特異性。該方法從單核苷酸水平上為各種復(fù)雜疾病和生物學過程的研究開辟了新思路。

來源：生物通