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當(dāng)前位置:南京沃博生物科技有限公司>>技術(shù)文章>>蛋白質(zhì)免疫共沉淀(CoIP)實(shí)驗(yàn)方案
溶液和試劑
裂解緩沖液
這些緩沖液可在 4 ℃ 下保存數(shù)周,或者以分裝形式在 -20 ℃ 下保存長達(dá) 1 年。
Nonidet-P40 (NP40) 緩沖液
150 mM NaCl
1.0% NP40(可用 0.1% Triton X-100 替代)
50 mM Tris-HCl pH 8.0
蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號 A10004)
RIPA 緩沖液(放射免疫沉淀試驗(yàn)緩沖液)
150 mM NaCl
1.0% NP-40 或 0.1% Triton X-100
0.5% 脫氧膽酸鈉
0.1% SDS(十二烷基硫酸鈉)
50 mM Tris-HCl pH 8.0
蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號 A10004)
Tris-HCl 緩沖液
20 mM Tris-HCl pH 7.5
蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號 A10004)
電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉緩沖液
Laemmli 2×緩沖液/上樣緩沖液
4% SDS
20% 甘油
0.004% 溴酚藍(lán)
0.125 M Tris-HCl
測定 pH 并調(diào)節(jié)至 pH 6.8。
電泳緩沖液(Tris-ganansuan/SDS)
25 mM Tris 堿
190 mMganansuan
0.1% SDS
測定 pH,pH 應(yīng)為約 8.3。必要時(shí)進(jìn)行調(diào)節(jié)。
轉(zhuǎn)膜緩沖液(濕轉(zhuǎn))
25 mM Tris 堿
190 mM ganansuan
20% 甲醇
測定 pH,pH 應(yīng)為約 8.3。必要時(shí)進(jìn)行調(diào)節(jié)。
對于大于 80 kDa 的蛋白質(zhì),推薦加入最終濃度為 0.1% 的 SDS。
轉(zhuǎn)膜緩沖液(半干轉(zhuǎn))
48 mM Tris
39 mMganansuan
20% 甲醇
0.04% SDS
封閉緩沖液
5% 奶粉(推薦使用,也可以用 BSA 牛血清白蛋白)
加入 TBST 緩沖液中?;靹虿⑦^濾。過濾失敗可能導(dǎo)致出現(xiàn)“斑點(diǎn)",其中微小的黑色顆粒
會在顯色過程中污染印跡。
實(shí)驗(yàn)步驟
A. 制備細(xì)胞裂解物
1. 吸干培養(yǎng)基。添加含有調(diào)節(jié)分子的新鮮培養(yǎng)基,使其在預(yù)定的時(shí)間內(nèi)對細(xì)胞進(jìn)行處理。
2. 收集細(xì)胞,去除培養(yǎng)基后用冰預(yù)冷的 1X PBS 洗滌細(xì)胞一次。
3. 去除 PBS,并在并在細(xì)胞培養(yǎng)容器中加入適量的已經(jīng)添加了 Cock tail 蛋白酶抑制劑的
Lysis buffer。每 107 個(gè)細(xì)胞加入 1ml 冰預(yù)冷的 Lysis buffe(相當(dāng)于 100mm 的培養(yǎng)皿,150cm2
的培養(yǎng)瓶),并在冰上孵育至少 5 分鐘。
4. 從板上刮下細(xì)胞,把提取物轉(zhuǎn)移至微量離心管。置于冰上。
5. 在冰上進(jìn)行 3 次超聲破碎,每次 5 秒。如果沒有超聲儀,請用帶注射器的針頭(20G-18G-
16G)冰上反復(fù)抽吸,直到裂解液澄清;
6. 在 4°C,在 14,000 x g 條件下,微量離心 10 分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到新管中。上清液即為細(xì)胞裂解物。如有必要,裂解物可保存在 –80°C。
注:細(xì)胞裂解物制備好之后,可先進(jìn)行蛋白免疫印跡法檢測,以此來確定細(xì)胞裂解物里存在
目標(biāo)蛋白。
B. 抗原抗體結(jié)合
1. 在新的離心管內(nèi)加入 500μl(含總蛋白 200-1000ug)細(xì)胞裂解物。
2. 加入目標(biāo)蛋白的單克隆/多克隆抗體(1-10μg,根據(jù)抗體使用說明書)。
3. 同時(shí)采用非特異免疫的同源抗體作為對照。
4. 在 4℃輕柔混合過夜。
C. 免疫復(fù)合物沉淀
1. 抗體孵育過夜后,加入 20μl Protein A/G。
2. 在 4℃溫和地混勻 1-3 小時(shí)或過夜。
3. 12000g 離心 1min,保留沉淀。
4. 使用 0.5ml 1*Wash buffer 清洗沉淀,12000g 離心 1min,保留沉淀。
5. 重復(fù)第 4 步,共計(jì)清洗 3 次。
注:清洗,去上清的時(shí)候需要注意避免吸走填料
D. 用蛋白免疫印跡法進(jìn)行分析
1. 在 20-50 μl 1* SDS 樣品緩沖液中重懸沉淀物。渦旋振蕩,然后再微量離心 30 秒。
2. 將樣品加熱至 95–100°C 并持續(xù) 2-5 分鐘,然后在 14,000 x g 下瞬時(shí)離心 1 分鐘。
3. 將樣品 (15-30 μl) 上樣到 SDS-PAGE 凝膠上。
4. 用蛋白質(zhì)印跡法分析樣品。
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