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大家都知道,人類身高是一個高度遺傳的多基因性狀。之前的研究確定了近700個對成人身高有貢獻的獨立變異。不過,目前發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)等位基因是常見的(MAF >5%),位于編碼區(qū)之外,并且對身高的影響也很小。稀有變異和低頻率變異在何種程度上影響復雜性狀?這個問題還沒有答案。
近,由加拿大、英國和美國的研究人員領(lǐng)導的一個團隊揭開了部分答案。他們已經(jīng)確定了幾十個稀有或低頻率的人類身高遺傳因素,而其中一些變異對成人身高的影響接近一英寸。
在這項研究中,研究人員利用ExomeChip芯片,對458,927名個體的基因分型數(shù)據(jù)進行分析,這些個體有著歐洲、非洲、東亞、南亞、西班牙和沙特阿拉伯血統(tǒng)。通過這個隊列及驗證組的分析(包含另252,501名個體),研究人員將范圍縮小到600個變異,它們與個體的成年身高有著明顯的關(guān)聯(lián)。
之后,研究人員繼續(xù)研究了83個非同義或剪接位點的變異。在參與者中,它們是稀有變異(MAF <1%)或以低頻率存在(1% < MAF ≤ 5%),包括與生長障礙有關(guān)的基因的變異,以及落在之前發(fā)現(xiàn)的SNP附近的不常見變異。
與之前GWAS研究鑒定出的數(shù)百個常見變異不同,研究人員估計,STC2、IHH及其他基因的低頻率變異有著相當顯著的身高影響。比如,攜帶異常序列的 STC2 基因?qū)セ钚?,從而使個體的身高增加 1-2 厘米。
低頻率的等位基因似乎對身高有著更大的影響。我們的結(jié)果與基于理論積累和經(jīng)驗證據(jù)的模型一致,表明對表型影響大的變異更可能是有害的,因此是稀有的。
通過基因分析、小鼠的功能實驗及其他后續(xù)工作,研究人員探索了這些關(guān)聯(lián)的生物學基礎(chǔ),強調(diào)了骨骼生長相關(guān)基因、激素信號通路及其他過程對身高的影響。他們指出,“我們的研究結(jié)果提供了強有力的證據(jù),說明稀有和低頻率的編碼變異對身高有貢獻。這一結(jié)論將對人類復雜表型的預測產(chǎn)生影響。”
作為其他人類復雜性狀和疾病的模型,研究人員希望通過這種方法來預測常見疾病的風險。“我們的想法是,如果我們能理解人類身高的遺傳學,那么我們可以應(yīng)用這些知識來開發(fā)遺傳工具,預測其他性狀或常見疾病的風險。”
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