當經(jīng)熒光染色或標記的單細胞懸液放入樣品管中，被高壓壓入流動室內(nèi)。流動室內(nèi)充滿鞘液，在鞘液的包裹和推動下，細胞被排成單列，以一定速度從流動室噴口噴出。在流動室的噴口上配有一個超高頻的壓電晶體，充電后振動，使噴出的液流斷裂為均勻的液滴，待測細胞就分散在這些液滴之中。將這些液滴充以正、負不同的電荷，當液滴流經(jīng)過帶有幾千伏的偏轉(zhuǎn)板時，在高壓電場的作用下偏轉(zhuǎn)，落入各自的收集容器中，沒有充電的液滴落入中間的廢液容器，從而實現(xiàn)細胞的分離。 [1] 
，從而對細胞（或微粒）的物理、生理、生化、免疫、遺傳、分子生物學性狀及功能狀態(tài)等進行定性或定量檢測的一種現(xiàn)代細胞分析技術(shù)，它可根據(jù)發(fā)射光的熒光強度和波長將發(fā)光顆粒亞群分開并可實現(xiàn)單克隆分選，能復雜樣本中的細胞進行鑒定、分類、定量和分離，單次可同時對其中一種到四種特定細胞進行超高速分選純化、高通量單克隆分選或細胞芯片制備。分選后的細胞能直接用于培養(yǎng)、移植、核酸提取、單細胞PCR擴增或原位雜交等，可進一步進行細胞基因、蛋白、功能水平的研究和不同細胞之間的差異化研究。硬件中樣本細胞丟棄的比例低于5%，保證樣本中目標細胞的高回收率。 [2] 
流式細胞分選儀
流式細胞分選儀
特點編輯
1. 少量細胞分選時，流式細胞分選精確度高（99%以上），速度快。的流式細胞儀的分選速度可達25000個細胞/秒以上，比傳統(tǒng)的分選速度提高了很多倍，需要一天的工作只需要幾小時就能完成。不過流式細胞儀分離細胞的量還是有一定的限制，一次分離的大合理量約為10個細胞。如果細胞量超過10個，則需要耗費10小時以上，分選后細胞的活力會受到很大的影響.
2. 可以同時進行多個Marker分選，正選負選同時進行。以前的流式細胞儀只能給液滴充上正電荷或負電荷，因此在電場中只能向左或向右偏轉(zhuǎn)，即兩路分選。儀器可以給液滴充以不同的電量，從而調(diào)整液滴的偏轉(zhuǎn)角度，實現(xiàn)多路分選。BD的FACSAria流式細胞儀就可以進行四路分選。
3. 不僅僅限于表面抗原，流式細胞儀可以根據(jù)任何能檢測到的發(fā)光度（如細胞體積）或熒光（如DNA、RNA或蛋白含量，酶活性，特異抗原）散射度差異來分離細胞。如果能保證流式細胞儀的無菌狀態(tài)，那么分選后的細胞還可以進行培養(yǎng)或其他分析。
4. 如果只是偶爾做幾次細胞分選的話，用流式分選還是比較劃算的，只需要準備樣品和抗體，交納一定的儀器使用費即可，不需要購買配套的設備。 [3] 
應用編輯
流式細胞分析/分選系統(tǒng)主要應用于： [4]  1）干細胞組織工程在研究；2）細胞增值、活性和凋亡研究；3）疾病細胞如炎癥細胞、腫瘤細胞等的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸研究；4）基因表達和表達調(diào)控研究；5）細胞內(nèi)信號傳導和生物大分子間相互作用研究；6）各種病原體如病毒、細菌等基礎和致病性和致病機理研究；7）藥理藥效和藥物開發(fā)研究；8）移植和細胞治療研究；9）生物材料對細胞結(jié)構(gòu)、活性和功能的影響等。利用儀器的分選功能分選得到高純度、高活性的稀有細胞，通過直接培養(yǎng)、誘導、增殖、分化、活化和移植等進行更深一步的細胞功能和細胞治療探索，還可以在此基礎上逆向進行基因組合蛋白質(zhì)組相關(guān)研究，尋找致病基因、致病蛋白和疾病信號傳導方式。