活細胞代謝成像新方法
通過基因工程技術(shù)使得細胞表達一種經(jīng)修飾(改造)過的RNA,又稱Spinach,研究人員能對活細胞中的小分子代謝物進行成像,并觀察它們隨時間變化是如何改變的。每個細胞新陳代謝都會產(chǎn)生代謝產(chǎn)物。假如能得知產(chǎn)物生成效率的話,就能辨識如癌癥狀態(tài)下細胞代謝的異?;虼_定藥物能否將細胞的代謝狀況恢復(fù)到正常狀態(tài)。
康奈爾大學(xué)威爾醫(yī)學(xué)院的研究人員說發(fā)表在3月9日的《科學(xué)》雜志上的相關(guān)論文詳細描述了這種*的技術(shù)方法,這一技術(shù)將有可能*顛覆以往對代謝組學(xué)的認識,提供數(shù)千種細胞內(nèi)代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化的化學(xué)指紋圖譜。
活細胞代謝成像新方法
威爾康乃爾醫(yī)學(xué)院藥理學(xué)副教授Samie R. Jaffrey博士說:“動態(tài)觀察到代謝產(chǎn)物的變化將為我們提供新的和強大的武器,方便我們了解代謝在疾病狀態(tài)下是如何改變的,并幫助我們找到可以將它們恢復(fù)到正常水平的方法”。Jaffrey博士領(lǐng)導(dǎo)威爾康乃爾的其他三名研究人員共同完成了這項研究。
他說:“細胞的代謝水平調(diào)控著細胞諸多功能,也正因為如此,代謝水平的變化可以是細胞內(nèi)在特定的時間內(nèi)發(fā)生什么變化的寫照”。
例如生物學(xué)家都知道,腫瘤細胞存在代謝異常,這些細胞對葡萄糖能源的利用存在異常并產(chǎn)生*的代謝產(chǎn)物如乳酸,從而有不一樣的新陳代謝過程。Jaffrey博士說:“能夠看到這些代謝異常的話,就可以了解癌癥的發(fā)生發(fā)展。但是到現(xiàn)在為止,測量活細胞中代謝產(chǎn)物一直非常困難。
Jaffrey博士和他的團隊展開的科學(xué)研究表明:可以用特定的RNA序列來檢測細胞中代謝產(chǎn)物的水平。這些RNAs是基于能在細胞發(fā)出綠色光的Spinach RNA設(shè)計的。Jaffrey博士研究小組修改Spinach的RNAs,使得它們一旦遇到它們專屬綁定的代謝物時就關(guān)閉,造成Spinach熒光開啟。他們設(shè)計出了RNA序列以追蹤細胞中五個不同代謝產(chǎn)物包括二磷酸腺苷、細胞能量分子ATP和參與調(diào)節(jié)基因活性的甲基化過程的SAM(S-腺苷蛋氨酸)水平的變化。他說:“在此之前,一直沒有人能夠?qū)崟r觀察到細胞中代謝產(chǎn)物水平是如何變化的”。
Jaffrey博士說:“在活細胞中運用RNA傳感器,研究人員能夠測量單個細胞中的目標(biāo)代謝產(chǎn)物水平隨著時間的變化而發(fā)生的改變,你可以看到這些代謝物如何響應(yīng)信號刺激或遺傳變化進而發(fā)生動態(tài)變化的。你可以篩選出能使得這些基因異常發(fā)生正?;乃幬铮覀兊囊粋€主要目標(biāo)是確定藥物是否能使細胞的新陳代謝正?;?/p>
新技術(shù)克服了現(xiàn)行的用綠色熒光蛋白(GFP)標(biāo)記活細胞以充當(dāng)傳感器的缺點。如果將綠色熒光蛋白和其他發(fā)光蛋白質(zhì)融合到能結(jié)合某種代謝物產(chǎn)物的自然存在的蛋白質(zhì)中的話,綠色熒光蛋白和其他發(fā)光蛋白質(zhì)就可以用來充當(dāng)代謝感應(yīng)器。但在某些情況下,代謝產(chǎn)物與自然存在的蛋白質(zhì)結(jié)合方式會扭轉(zhuǎn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),進而影響已經(jīng)融入到這些蛋白質(zhì)中的熒光蛋白。另外,對于大多數(shù)的代謝產(chǎn)物,并沒有可用來融合綠色熒光蛋白以制造傳感器的蛋白質(zhì)。
通過使用RNA作為代謝物傳感器,這個問題引刃而解了。Jaffrey博士說:“關(guān)于RNA令人驚奇的是,你可以得到基本上你想要結(jié)合任何一種小分子代謝物的RNA序列。他們可以在幾個星期就能生產(chǎn)出來”。然后,這些人造序列融合到Spinach中,并在細胞中以單鏈RNA的形式表達。
Jaffrey博士說:“這種做法能讓你得到任何你想研究的小分子代謝物,以及這些小分子代謝物在細胞內(nèi)的情況”,他和他的同事們將這一技術(shù)的運用范圍擴大到能檢測活細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)和其他分子。
他補充說道:該技術(shù)可應(yīng)用于多種疾病研究中。Jaffrey博士說:“我們非常有興趣研究導(dǎo)致發(fā)育障礙如自閉癥的大腦神經(jīng)細胞內(nèi)的代謝如何是變化的,有很多的機會能讓這一新的工具發(fā)揮用處”。
這篇研究論文的合著者包括威爾康乃爾醫(yī)學(xué)院藥理系Jeremy S. Paige博士、Thinh Nguyen Duc博士、Wenjiao Song博士。
這項研究由美國國立衛(wèi)生研究院的生物醫(yī)學(xué)成像和生物研究所以及McKnight基金會資助??的螤柨萍计髽I(yè)和商業(yè)中心(CCTEC)已經(jīng)代表康奈爾大學(xué)提出了這項技術(shù)的保護申請。Samie Jaffrey博士是Lucerna技術(shù)的創(chuàng)始人和科學(xué)顧問,并持有該公司股權(quán)。此外,Lucerna技術(shù)擁有上述描述技術(shù)的相關(guān)許可證。活細胞代謝成像新方法