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當(dāng)前位置:上海逸峰生物科技有限公司>>公司動(dòng)態(tài)>>院士Science發(fā)重大成果:*個(gè)植物蛋白互作圖譜
來自北卡羅來納州大學(xué)教堂山分校(University of north carolina at chapel hill),哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員進(jìn)行了針對植物的蛋白相互作用系統(tǒng)分析,獲得了*個(gè)植物系統(tǒng)蛋白相互作用圖譜(Plant Interactome),這對于分析了解植物蛋白相互關(guān)系具有重要的意義。這一研究成果公布在Science雜志上。
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文章的通訊作者包括Jeffery L. Dangl教授等多人,其中來自北卡羅來納大學(xué)的Dangl教授是的生物學(xué)家,曾在植物對疾病產(chǎn)生應(yīng)答的信號過程,以及基因分析研究方面獲得重要成果。2007年當(dāng)選為美國國家*院士。
這項(xiàng)研究是“擬南芥蛋白互作組圖譜聯(lián)盟”的一項(xiàng)成果——“擬南芥蛋白互作組圖譜聯(lián)盟”是由20多個(gè)國立和實(shí)驗(yàn)室組成的,致力于了解植物蛋白相互關(guān)聯(lián)的項(xiàng)目,歷時(shí)4年,由美國國家科學(xué)基金會National Science Foundation 資助800萬美元。
研究人員首先分析獲得了上萬個(gè)開放閱讀框(ORF),然后利用酵母雙雜交技術(shù)對這些ORF進(jìn)行檢測,結(jié)果在40萬次蛋白分析實(shí)驗(yàn)中,共發(fā)現(xiàn)了6250個(gè)蛋白互作樣本,其中有2774種蛋白參與。這些蛋白互作樣本在擬南芥完整蛋白作用譜中僅占大約2%,這主要是由于分析實(shí)驗(yàn)僅覆蓋擬南芥完整蛋白的三分之一,而且由于靈敏度的原因,許多較弱的蛋白相互作為無法檢測到。這也就是說未來也許還會有更全面的蛋白作用圖譜。
不過利用*植物蛋白互作圖譜,研究人員可以將整理分類這些互作蛋白,從而可以用于揭示協(xié)同作用蛋白的系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)。研究人員發(fā)現(xiàn)1900對互作蛋白可能是原始基因拷貝擴(kuò)增的產(chǎn)物,而擬南芥基因組數(shù)據(jù)表明植物基因的隨機(jī)拷貝數(shù)比動(dòng)物的多,這些基因拷貝使得植物具有適應(yīng)環(huán)境變化的遺傳多樣性。
研究人員還利用*的測序技術(shù),演算出了單一基因拷貝擴(kuò)增事件的時(shí)間跨度,并比較了基因拷貝擴(kuò)增和結(jié)合蛋白成分的變化,這將有助于科學(xué)家們估算進(jìn)化過程中這些蛋白的功能如何在一起。
這些研究數(shù)據(jù)為科學(xué)家們提供了蛋白互作的雙重?cái)?shù)據(jù),這些數(shù)據(jù),以及將來的蛋白互作組圖譜將組成一個(gè)信息庫,利用這些信息,研究人員將可以獲得具有更高的抗旱性、抗病性的農(nóng)業(yè)物,以及更有營養(yǎng),對人類更有益的新型農(nóng)產(chǎn)品。
來源:生物通
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