在人們發(fā)現(xiàn)感染有李斯特氏菌種（Listeria，致死性菌）的科羅拉多甜瓜之后，到Steven  Soderbergh的《全境擴(kuò)散（Contagion）》——一部講述某種病毒帶來(lái)的世界性災(zāi)難的電影——上映，微生物經(jīng)歷了一個(gè)在“公共關(guān)系”上的困難時(shí)期。面對(duì)它們潛在的致死性，你自然會(huì)有種要樹立“防火墻”的急切需求：別再握手，別再共用手機(jī)，還有——雖然上帝不允許——別再性交了。

但將你生命中的微生物全部?jī)艋羰遣豢赡艿?。微生?mdash;—細(xì)菌、真菌、及其它微觀組織——是地球上為數(shù)zui多的生命。實(shí)際上，在相當(dāng)程度上，你也是微生物。“你”體內(nèi)大約90%的細(xì)胞和99%的遺傳物質(zhì)屬于病毒，而并不屬于你。由于病毒細(xì)胞較人類細(xì)胞個(gè)頭小，它們只占你體重的10%，但你隨身攜帶的這些細(xì)胞幾乎都有它們自己的小九九。

問(wèn)題是，我們只能在zui模糊的層面上了解它們的如意算盤。它們的普遍性造成了研究上的困難。對(duì)研究來(lái)說(shuō)，它們太小了。傳統(tǒng)的解決方案是在實(shí)驗(yàn)室中將一個(gè)單獨(dú)菌種隔離并培養(yǎng)。但微生物與其他生命形式一樣，都是群居動(dòng)物。正如動(dòng)物園里的大猩猩與面對(duì)無(wú)花果樹、美洲豹、或另一只同類的野生猩猩不同，在皮氏培養(yǎng)皿（Petri  dish）中單獨(dú)培養(yǎng)的微生物并不會(huì)展現(xiàn)它在自然環(huán)境中所表現(xiàn)出的許多行為。對(duì)任何生物體的研究而言，zui有意思的要數(shù)它對(duì)其它生物體的反應(yīng)——它會(huì)吃掉它們、逃離、還是與它們社交？

然而，微生物“社區(qū)”太復(fù)雜了——你的腸子里、或者任意一立方英尺的土壤中就生活著逾千種微生物——實(shí)在是無(wú)法知道誰(shuí)在對(duì)誰(shuí)做什么。到底是附近的99種微生物中的哪一種導(dǎo)致了抗生素的產(chǎn)生？是什么讓這個(gè)休眠期的病毒開始*的繁殖？

為了對(duì)微生物相互作用有所了解，我們需要研究簡(jiǎn)化但仍然真實(shí)的微生物種群。這曾經(jīng)是哈佛大學(xué)微生物學(xué)家Rachel  Dutton所面臨的挑戰(zhàn)。她希望尋找到一個(gè)足夠又不過(guò)度復(fù)雜、本身就已經(jīng)被隔離的種群進(jìn)行研究。有一天，她意識(shí)到她自出生以來(lái)就在食用她的理想研究對(duì)象：奶酪。

吃奶酪其實(shí)是在吃微生物

手工奶酪與其說(shuō)是用牛奶制作的，不如說(shuō)是用細(xì)菌、真菌、以及它們的副產(chǎn)物制作而成的——牛奶僅僅是這些微生物的養(yǎng)料。每一塊奶酪就如同一個(gè)微小的、資源豐沛的孤島，在此同時(shí)放逐著一批微生物種群，“生還者”模式。Dutton現(xiàn)在正處在哈佛大學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)中心一個(gè)五年期項(xiàng)目的*年，她將與博士后研究員Benjamin  Wolfe合作，在實(shí)驗(yàn)室中重現(xiàn)這些孤島社區(qū)，然后了解誰(shuí)將興旺，誰(shuí)將被出賣，還有誰(shuí)會(huì)被驅(qū)趕出孤島。為完成這一任務(wù)，他們需要從一塊特定的奶酪中分離出所有的微生物，在實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行培養(yǎng)，在一系列有著細(xì)微變化的不同環(huán)境中將它們重新混合，然后觀察會(huì)發(fā)生什么。

“zui終我們希望能理解使得這些微生物體共生的基因和路徑。”Dutton說(shuō)道。

這將對(duì)我們的健康有重要影響，并幫助我們更全面地了解微生物是如何相互作用的。比如說(shuō)，研究微生物群落zui初是怎樣形成的，能幫助我們理解感染是如何發(fā)生的，為什么特定的病原體突然大量繁殖，以及我們?cè)鯓硬拍苁怪Ｖ?。這樣的研究同樣能幫助我們用更適合的方法建立體內(nèi)微生物群落，而不只是通過(guò)如今風(fēng)靡的大量飲用酸奶法。

Dutton和Wolfe在位于佛蒙特州的Jasper  Hill農(nóng)場(chǎng)啟動(dòng)了他們的項(xiàng)目，該農(nóng)場(chǎng)以其全美zui多樣的奶酪地窖、以及從其奶酪外表皮產(chǎn)生的擦奶酪聞名。他們已經(jīng)在Winnimere——一種以其豐富口感、強(qiáng)烈氣味而著稱的洗浸乳酪（washed-rind  cheese）——上發(fā)現(xiàn)了15種不同的微生物。其中不乏預(yù)料之中的種類，如早先已在歐洲zui美味的洗浸乳酪上發(fā)現(xiàn)的一種細(xì)菌。此外亦有一些新發(fā)現(xiàn)，包括幾種先前僅在環(huán)境如北冰洋和挪威海峽中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌。這些微生物中，有些一直生存下來(lái)，在奶酪表皮上開出絢爛之花；而另一些則被新物種取代，如同草退林豐。

Dutton表示奶酪的根本在于微生物群落。“我們聞到的士微生物的味道，而不是奶酪的。而我們品嘗的亦是微生物。”（其實(shí)當(dāng)我們食用Gorgonzola奶酪的藍(lán)紋、Brie奶酪的絨毛、或是Limburger奶酪的橘色糊糊，我們正吞下數(shù)百萬(wàn)活著的微生物。）“當(dāng)我們將這些生物體在實(shí)驗(yàn)室中（與奶酪）隔離，它們聞起來(lái)與奶酪?guī)缀跻粯印Ｎ覀兂３Ｂ勚鼈冋f(shuō)，‘嗯，這就是Winnimere！’”事實(shí)上他們的冰箱已經(jīng)變成周圍實(shí)驗(yàn)室的痛處。“冷卻器周圍可不好聞，”Wolfe承認(rèn)。

而這樣的味道在美國(guó)的奶酪商聞起來(lái)卻帶有成功的清香，他們長(zhǎng)期尋找能夠復(fù)制傳統(tǒng)歐洲奶酪風(fēng)味的方法。在我們對(duì)微生物有所了解的多個(gè)世紀(jì)前，人們就已經(jīng)發(fā)明了這些傳統(tǒng)奶酪；奶酪商僅僅知道特定工序能夠制造出特定風(fēng)味的奶酪。比如說(shuō)，意大利干酪的生產(chǎn)商了解到（如果要制作干酪他們就要）在每天用于制造奶酪的牛奶中混合前一天的乳清。而zui棒的奶酪得益于地理學(xué)上幸運(yùn)的意外。將羊奶凝乳放在法國(guó)小鎮(zhèn)羅克福爾（Roquefort-sur-Soulzon）附近的巖洞內(nèi)，幾個(gè)月后當(dāng)你回到這里，你就能收獲一塊藍(lán)紋杰作；當(dāng)然我們現(xiàn)在知道這得歸功于巖洞內(nèi)的羅克福爾青霉菌（Penicillium）。在此之后，我們可以通過(guò)這些的奶酪培養(yǎng)（微生物群）從而在世界各地復(fù)制出它們的風(fēng)味。

微生物是奶酪成功的功臣

雖然微生物（在奶酪產(chǎn)生中）扮演的角色被漸漸發(fā)掘，奶酪商卻只能夠識(shí)別他們奶酪中zui為明顯的微生物，因此源于實(shí)驗(yàn)室的奶酪無(wú)法*還原傳統(tǒng)奶酪的豐富風(fēng)味，后者是由在真實(shí)而古老的歐洲奶酪?guī)r洞內(nèi)的微生物群落產(chǎn)生的。這是幾乎沒(méi)有任何美國(guó)奶酪能夠達(dá)到歐洲奶酪的強(qiáng)烈風(fēng)味與復(fù)雜度的原因之一。歐洲人將其歸功于“地域”，即產(chǎn)地半神秘的*性，但當(dāng)?shù)氐奈⑸锟赡苁钦嬲墓Τ肌?/p>

Dutton和Wolfe現(xiàn)在開始同時(shí)研究美國(guó)奶酪和傳統(tǒng)歐洲奶酪，如Valençay、St.  Nectaire、以及Stilton，他們的目標(biāo)是識(shí)別出上述各種奶酪上所有的微生物。“我們希望了解不同種類奶酪商*的微生物群落特征，”Wolfe說(shuō)。如果他們能夠?qū)⑻囟ǖ奈⑸锱c特定的風(fēng)味和紋理起來(lái)，Dutton和Wolfe或許能為美國(guó)的奶酪商帶來(lái)福音，將歐洲神靈不為外人道的寶貴學(xué)問(wèn)傳授給這些美國(guó)奶酪商。“我們能夠告訴奶酪商，如果加入這種白地霉（Geotrichum）菌種，你將得到更多的物種X，”Wolfe預(yù)測(cè)到，“而我們知道物種X產(chǎn)生花香味。你將很可能會(huì)有一個(gè)做預(yù)測(cè)的根據(jù)。在奶酪界沒(méi)人能深入了解到基因?qū)用?。人們期望種瓜得瓜，但（事實(shí)上）是在碰運(yùn)氣，因?yàn)樗麄冎皇前言现糜谝粋€(gè)未知的環(huán)境中。”
 

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