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據(jù)《紐約時(shí)報(bào)》報(bào)道，科學(xué)家們努力尋找一種能夠控制血管生長的藥物，從而殺死腫瘤細(xì)胞，但通過對基因的進(jìn)一步探索，居然發(fā)現(xiàn)控制血管生長的基因來自于酵母菌，而并非動(dòng)物。更加讓科學(xué)家震驚的是，有大量與人類疾病密切相關(guān)的基因，卻出現(xiàn)在與人關(guān)系zui遠(yuǎn)的物種體內(nèi)。

愛德華 馬科特（Edward  M.  Marcotte）正在尋找一種藥物，能夠阻止血管生長從而殺死腫瘤細(xì)胞。zui近他和他德克薩斯大學(xué)的同事們發(fā)現(xiàn)了一些很好的靶目標(biāo)――五種控制人類血管生長*的基因?，F(xiàn)在他們在尋找可以阻止這些基因表達(dá)的藥物。奇怪的是馬科特博士不是在人類基因組內(nèi)發(fā)現(xiàn)的這些新基因，也是不在實(shí)驗(yàn)鼠身上，甚至不是在果蠅身上。這些新基因是在酵母菌體內(nèi)找到的。

“從表面看來，這簡直是太*了。”馬科特博士說。畢竟這些單細(xì)胞真菌不需要制造血管。它們甚至根本就沒有血液。原來，在酵母菌中，這五種基因聚合在一起，共同完成一個(gè)和產(chǎn)生血管互不相關(guān)的工作――修復(fù)細(xì)胞壁。

更加*的是，馬科特博士和他的同事們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種其它基因，它們雖然是在和人類關(guān)系很遠(yuǎn)的物種體內(nèi)找到的，卻和人類疾病密切相關(guān)。例如，他們在植物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了耳聾相關(guān)基因；在線蟲類動(dòng)物身上發(fā)現(xiàn)了乳腺癌相關(guān)基因。他們研究成果zui近發(fā)表在《美國國家*學(xué)報(bào)》上。

這些科學(xué)家們利用了我們演化*的特性。在我們的變形蟲樣的祖先體內(nèi)基因的集群已經(jīng)聚合在一起完成修建細(xì)胞壁和其它生命活動(dòng)所必需的基本任務(wù)。十億年后的今天，很多這些基因仍然在一起工作，只不過在不同的生物體內(nèi)完成著不同的任務(wù)。

此類的研究給達(dá)爾文的物種起源演化觀點(diǎn)提供了新的轉(zhuǎn)折。在19世紀(jì)中葉，解剖學(xué)家們著迷于不同物種性狀的潛在的相似性――比如蝙蝠的翅膀和人類的手具有相似的結(jié)構(gòu)。達(dá)爾文主張這種相似性是因?yàn)樗鼈儊碜杂谕患易遄V系――我們稱之為同源性。蝙蝠和人類具有共同的祖先，所以他們共同繼承了具有五個(gè)手指的四肢。

差不多150年的研究已經(jīng)充分證明了達(dá)爾文的深刻見解。舉例來說，古生物學(xué)家已經(jīng)發(fā)現(xiàn)大量過渡性化石，解決了許多模糊不清的同源性問題。其中一個(gè)例證就是鯨魚和海豚的氣孔和人類的鼻孔之間?；C據(jù)顯示了鯨類祖先的鼻孔是怎樣從鼻子末端演變到頭部上方的。

上世紀(jì)50年代，對同源性的研究進(jìn)入一個(gè)全新時(shí)代?？茖W(xué)家開始發(fā)現(xiàn)了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的相似性。例如，不同的物種具有不同形式的血紅素。每種形式適用于一種特別的生命樣式，但是它們卻是從同一個(gè)祖先分子演變而來的。

當(dāng)科學(xué)家開始測序DNA序列時(shí)候，他們同樣發(fā)現(xiàn)了基因之間的同源性。代代相傳的過程中，基因有時(shí)獲得意外的副本。每個(gè)副本都會(huì)有特定的突變。但是他們的序列仍然保持足夠的相似性，顯示他們具有共同的來源。一個(gè)像手臂這樣的性狀是由許多基因編碼互相協(xié)作而成。許多基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)聯(lián)合起來共同起作用。還有另外一種情況，一種基因編碼蛋白質(zhì)的開關(guān)受到另一種基因控制。

研究結(jié)果顯示這些基因集群――有時(shí)被稱作基因模塊，一起保持合作經(jīng)歷了數(shù)百萬年的歷程。但是他們在不同物種中針對各自*的方式進(jìn)行了重新組裝，對新的信號作出反應(yīng)，幫助建立新的性狀。

威斯康星大學(xué)的肖恩 卡羅爾（Sean  B.Carroll）和芝加哥大學(xué)的尼爾 舒賓（Neil Shubin）還有哈佛醫(yī)學(xué)院的哈里夫 塔賓（Cliff  Tabin）在1997年聯(lián)合發(fā)表了一篇很有影響力的論文，其中他們?yōu)檫@些“借用”的基因模塊創(chuàng)造了一個(gè)新學(xué)術(shù)名詞――“深同源性”。

從那時(shí)起，科學(xué)家對許多深同源性的例子進(jìn)行了更為詳細(xì)的研究?？_爾博士和他的同事zui近通過重組基因模塊發(fā)現(xiàn)了果蠅翅膀上的斑點(diǎn)是如何演化而來的。一種小型果蠅變種翅膀上長有16個(gè)*的斑點(diǎn)圖案?？_爾發(fā)現(xiàn)控制這些斑點(diǎn)分布的基因同許多果蠅體內(nèi)控制翅膀紋理和感覺器官的是同一組基因。這些模塊被果蠅借用來布置斑點(diǎn)。

我們的眼睛同樣是深同源性的產(chǎn)物。水母的感光器官看起來與我們的眼睛*不同，但是，它們都是由相同的基因模塊產(chǎn)生的感光分子。

科學(xué)家還發(fā)現(xiàn)我們的神經(jīng)系統(tǒng)與某些單細(xì)胞生物有著更深度的同源性。神經(jīng)元細(xì)胞依靠突觸形成連接相互。神經(jīng)元細(xì)胞利用一套基因網(wǎng)絡(luò)建立一個(gè)完整的支架系統(tǒng)來支撐突觸。今年2月法國國家科學(xué)研究中心的亞歷山大?阿烈（Alexandre  Alié）和邁克爾 曼努艾爾（Michael  Manuel）報(bào)道在一種叫做領(lǐng)鞭蟲的單細(xì)胞動(dòng)物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了13個(gè)這種支架系統(tǒng)基因。

沒有人確切地知道這些神經(jīng)元細(xì)胞基因?qū)︻I(lǐng)鞭蟲有什么作用?？梢源_定的一點(diǎn)是它們不會(huì)被用來建立神經(jīng)元突觸支架。

直到現(xiàn)在，科學(xué)家們只是偶然發(fā)現(xiàn)深同源性的例子。馬科特博士想知道是否有可能加快發(fā)現(xiàn)的進(jìn)程。他推斷，深同源性的證據(jù)可能已經(jīng)躺在科學(xué)文獻(xiàn)里等待我們?nèi)グl(fā)現(xiàn)――具體來說，科學(xué)家為弄清各種各樣的基因如何在物種體內(nèi)運(yùn)作已經(jīng)做了成千上萬的研究工作，深同源性的證據(jù)可能就在這些研究中。

科學(xué)家已經(jīng)可以識別數(shù)千種人類基因，如果它們發(fā)生突變，就會(huì)導(dǎo)致人體患病。另外的研究人員也系統(tǒng)地誘變了6600個(gè)酵母菌基因，并觀察了這些變異酵母菌在不同條件下如何生存發(fā)展的。馬科特博士推測如果能夠解析這兩組數(shù)據(jù)，他就可能發(fā)現(xiàn)一些基因模塊，雖然起著各自不同的作用，卻能共同分布在關(guān)系較遠(yuǎn)的物種體內(nèi)。

馬科特博士和他的同事建立了一個(gè)數(shù)據(jù)庫，其中包括了1923個(gè)與人類疾病相關(guān)基因。在此基礎(chǔ)上他們又添加了來自于小鼠、酵母菌和線蟲類動(dòng)物的10000個(gè)性狀相關(guān)基因。然后，科學(xué)家們就開始尋找不同物種內(nèi)產(chǎn)生不同性狀的相關(guān)基因。于是，他們發(fā)現(xiàn)了文章開頭提到的五個(gè)幫助建造血管的基因與酵母菌中的五個(gè)修復(fù)細(xì)胞壁的基因密切相關(guān)。

在發(fā)現(xiàn)這些共享基因后，馬科特又取得了新的進(jìn)展。他們在數(shù)據(jù)庫內(nèi)一共找到了67個(gè)酵母修復(fù)細(xì)胞基因。如果酵母菌和人類繼承了一個(gè)共同祖先的基因模塊，我們就可以利用酵母的其它相關(guān)基因版本來建造血管。

科學(xué)家研究了其它62種細(xì)胞壁修復(fù)基因。為此，他們在青蛙體內(nèi)建立了相關(guān)基因版本，并且觀察每一個(gè)基因在青蛙胚胎發(fā)育中是如何表現(xiàn)的。他們從中發(fā)現(xiàn)了另外5個(gè)基因同樣可以產(chǎn)生蛋白質(zhì)，發(fā)育生成血管。為了找到這些蛋白質(zhì)對生成血管的重要性，他們逐個(gè)關(guān)閉編碼這些蛋白質(zhì)的基因，觀察青蛙胚胎如何發(fā)育。

德克薩斯大學(xué)的發(fā)育生物學(xué)家約翰 沃靈福德（John  Wallingford）是本項(xiàng)研究的合作者，他說：“我們zui終發(fā)現(xiàn)了嚴(yán)重的血管缺陷。”馬科特猜想人類與關(guān)系更遠(yuǎn)的植物是否也會(huì)有共同的基因模塊。他和同事們擴(kuò)展了他們的數(shù)據(jù)庫，加入了擬南芥（Arabidopsis  thaliana）22921個(gè)性狀相關(guān)基因。

令人吃驚的是科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了48個(gè)人類和植物共有基因模塊。  “當(dāng)時(shí)實(shí)驗(yàn)室大廳里一片尖叫。”  馬科特博士回憶說。

通過進(jìn)一步研究，科學(xué)家挑選出一種奇特的人類與植物共有基因模塊。這些基因與人體一種罕見遺傳疾病瓦登伯格綜合癥有關(guān)。它是由胚胎神經(jīng)嵴細(xì)胞紊亂導(dǎo)致的。通常情況下，神經(jīng)峭細(xì)胞在胚胎內(nèi)延伸，沿著背部形成一條帶狀分布。然后他們發(fā)育形成神經(jīng)細(xì)胞、色素生成細(xì)胞和一部分顱骨。瓦登伯格綜合癥患者的癥狀分散在由神經(jīng)峭細(xì)胞發(fā)育生成的身體各個(gè)部分中。他們包括耳聾、瞳距過寬、前額有白發(fā)還有面部白斑等。

科學(xué)家發(fā)現(xiàn)兩種瓦登伯格綜合癥相關(guān)基因與擬南芥的重力感應(yīng)基因相匹配。如果這些基因發(fā)生變異，植物就不能豎直向上生長了。馬科特和他們同事在他們的數(shù)據(jù)庫內(nèi)又找到3種擬南芥的重力感應(yīng)基因。他們決定測試這三個(gè)基因是否也會(huì)在瓦登伯格綜合癥中起作用。

他們發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)植物基因在青蛙的胚胎神經(jīng)峭細(xì)胞中能夠發(fā)揮作用。當(dāng)他們關(guān)閉神經(jīng)峭中的這個(gè)基因的時(shí)候，胚胎就發(fā)生了畸形?？_爾博士認(rèn)為這項(xiàng)新工作是早期研究發(fā)展的必然結(jié)果。“深同源性正在受到此類研究的推動(dòng)，這讓我們倍感欣慰。”他說。

“這是一種找出人類致病基因非常有效的方法，”加利福尼亞大學(xué)戴維斯分校的大衛(wèi) 布萊基斯科（David  Platchetzski）表示，他沒有參與此項(xiàng)研究，“這可以讓我們更快地向前發(fā)展。”