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上海酶聯(lián)生物研究所
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上海酶聯(lián)生物研究所
閱讀：1548發(fā)布時(shí)間：2011-4-11
宏基因組學(xué)
基因組學(xué)（genomics）
隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃的實(shí)施而誕生,現(xiàn)已成為后基因組時(shí)代一門(mén)重要的生命科學(xué)學(xué)科.研究者已經(jīng)逐漸習(xí)慣于在對(duì)生物體的個(gè)別基因或蛋白質(zhì)研究之前,先測(cè)定或分析該物種的基因組序列.目前已經(jīng)知道全基因組序列的真核生物有40多種,而原核生物則多達(dá)200多種.這些工作表明,研究人員在基因組序列分析方面已經(jīng)取得了巨大的進(jìn)展.但是,對(duì)于自然界現(xiàn)存的物種而言,人類(lèi)所測(cè)定的物種依然是少之又少.在原核生物世界中,僅僅是被命名的就達(dá)到5700種,而那些未知微生物的種類(lèi)則可能多達(dá)上百萬(wàn)種。
宏基因組 （也稱(chēng)元基因組學(xué)， Metagenome）
是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名詞, 其定義為“the genomes of the total microbiota found in nature” , 即生境中全部微小生物遺傳物質(zhì)的總和。它包含了可培養(yǎng)的和未可培養(yǎng)的微生物的基因, 目前主要指環(huán)境樣品中的細(xì)菌和真菌的基因組總和。
宏基因組學(xué) （元基因組學(xué)， metagenomics）
就是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體基因組為研究對(duì)象, 以功能基因篩選和/或測(cè)序分析為研究手段, 元基因組學(xué)（ Metagenomics）通過(guò)非培養(yǎng)方法進(jìn)行微生物群落組成的鑒定,主要技術(shù)包括DNA的提取、文庫(kù)的構(gòu)建和目標(biāo)基因克隆的篩選和元基因組直接進(jìn)行高通量測(cè)序分析,可用于發(fā)現(xiàn)新基因、開(kāi)發(fā)新的生物活性物質(zhì)、研究群落中微生物多樣性和基因組成與功能預(yù)測(cè)等方面。 以微生物多樣性、種群結(jié)構(gòu)、 進(jìn)化關(guān)系、 功能活性、 相互協(xié)作關(guān)系及與環(huán)境之間的關(guān)系為研究目的的新的微生物研究方法。
特定生物種基因組研究使人們的認(rèn)識(shí)單元實(shí)現(xiàn)了從單一基因到基因集合的轉(zhuǎn)變，宏基因組研究將使人們擺脫物種界限，揭示更高更復(fù)雜層次上的生命運(yùn)動(dòng)規(guī)律。在目前的基因結(jié)構(gòu)功能認(rèn)識(shí)和基因操作技術(shù)背景下，細(xì)菌宏基因組成為研究和開(kāi)發(fā)的主要對(duì)象。細(xì)菌宏基因組細(xì)菌人工染色體文庫(kù)篩選和基因系統(tǒng)學(xué)分析使研究者能更有效地開(kāi)發(fā)細(xì)菌基因資源，更深入地洞察細(xì)菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來(lái)源。
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