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提取古代DNA樣本現(xiàn)況研究

時(shí)間:2017-8-24閱讀:237
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顳骨含有極其豐富的古代 DNA。 圖片來(lái)源:Balázs G. Mende, Lab. Archaeogenetics, RCH HAS

3 名考古學(xué)家在一封日前發(fā)表于《自然》雜志的信件中指控稱,利用來(lái)自古代人類和動(dòng)物的 DNA 記錄過(guò)去的努力已變成一場(chǎng)殘酷的“骨頭”——只有少數(shù)遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)室囤積著珍貴的樣品。

科學(xué)家呼吁對(duì)富含 DNA 的骨頭樣品實(shí)行更加嚴(yán)格的管理制度,以確保它們能被多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)獲取用于開展研究。他們列舉了以色列新成立的一個(gè)中心作為例子。該中心將充當(dāng)全國(guó)性的信息資源庫(kù),管理來(lái)自考古地點(diǎn)的動(dòng)物骨頭,以便很多研究人員能獲取到樣品用于遺傳分析。

“目前,這些資源面臨著很大的壓力。”上述信件共同作者、德國(guó)基爾大學(xué)考古學(xué)家 Cheryl Makarewicz 表示,“問(wèn)題在于資源不夠分配。”

Makarewiczhe 和同事尤其擔(dān)心內(nèi)耳中的一部分骨頭,即顳骨,因?yàn)樗刑貏e豐富的古代 DNA。“對(duì)這些罕見樣品的爭(zhēng)奪導(dǎo)致囤積現(xiàn)象的出現(xiàn)。再加上為了進(jìn)行 DNA 分析而破壞樣品,再現(xiàn)研究成果變得非常困難。”Makarewiczhe 和同事在信件中寫道,“這同時(shí)阻止了和控制此類樣品獲取的極少數(shù)研究組沒有關(guān)聯(lián)的科學(xué)家開展研究。”

與此同時(shí),Makarewicz 表示,為未來(lái)一代的科學(xué)家保存好樣品也非常重要,因?yàn)樗麄兛赡馨l(fā)明出更好的方法來(lái)提取經(jīng)過(guò)*批測(cè)試后仍保留在樣品中的 DNA,而且諸如同位素分析等其他技術(shù)也會(huì)隨之改善。

在過(guò)去的幾年里,遺傳學(xué)家從各地的考古遺址收集了上百個(gè)樣品,其中很多是顳骨,并且將其用于通常會(huì)引起轟動(dòng)的古代基因組學(xué)論文。這些論文描繪了農(nóng)業(yè)、語(yǔ)言和鮮為人知的文化的擴(kuò)散。

“這種情況有點(diǎn)像當(dāng)時(shí)美國(guó)西部的狂熱開發(fā)局面。若干研究古代 DNA 的實(shí)驗(yàn)室每天都會(huì)同世界各地的博物館打交道。”丹麥自然歷史博物館進(jìn)化遺傳學(xué)家 Eske Willerslev 表示。2015 年,Willerslev 團(tuán)隊(duì)發(fā)表了*古代基因組研究,對(duì) 100 多個(gè)樣品的 DNA 進(jìn)行了測(cè)序。該研究描繪了一次起源于俄羅斯和烏克蘭草原的銅器時(shí)代大規(guī)模遷移。

美國(guó)哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院人口遺傳學(xué)家 David Reich 和另一位的古 DNA 研究人員表示,保存考古樣品至關(guān)重要。不過(guò),Reich 介紹說(shuō),他的實(shí)驗(yàn)室對(duì)骨頭進(jìn)行了取樣,從而使對(duì)骨頭的破壞zui小化,并且打算將殘余部分在一年內(nèi)還回去。他同時(shí)表示,實(shí)驗(yàn)室愿意分享來(lái)自顳骨樣品的多余骨頭粉末,產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也可以免費(fèi)被獲取到。

信件共同作者、海法大學(xué)考古動(dòng)物學(xué)家 Guy Bar-Oz 介紹說(shuō),一個(gè)今年年初在海法開放的中心將充當(dāng)古代 DNA 研究中所使用動(dòng)物骨頭的信息資源庫(kù)。

在以色列挖掘遺址的研究人員不會(huì)被要求把樣品存放在該機(jī)構(gòu)內(nèi)。不過(guò),Bar-Oz 表示,該中心由以色列文物管理局共同管理的事實(shí)意味著在以色列獲取的大多數(shù)動(dòng)物顳骨樣品已經(jīng)在那里了??茖W(xué)家必須申請(qǐng)?jiān)S可,才能對(duì)材料取樣,而數(shù)據(jù)共享也將被嚴(yán)格執(zhí)行。

并非所有考古學(xué)家都被這個(gè)想法吸引。“我并不支持設(shè)立這種類型的中心機(jī)構(gòu)。我認(rèn)為,像這樣限制科研不符合任何人的利益。”紐約哈特威克學(xué)院考古學(xué)家 David Anthony 表示。他向 Reich 實(shí)驗(yàn)室提供了銅器時(shí)代的樣品,而 Reich 在提取了樣品 DNA 后也不附帶任何條件地將它們還了回去。

同古 DNA 研究人員開展合作的英國(guó)倫敦大學(xué)學(xué)院考古學(xué)家 Marc Vander Linden,對(duì)古 DNA 信息資源庫(kù)的想法表示支持。不過(guò),他并不確定集中化的樣品存儲(chǔ)是否適用于所有國(guó)家。他指出,很多國(guó)家并未擁有在考古發(fā)掘上掌握權(quán)力的*機(jī)構(gòu),就像以色列文物管理局那樣。

Vander Linden 表示,挖掘和保存樣品的考古學(xué)家應(yīng)承擔(dān)起責(zé)任,想各種辦法解決這個(gè)問(wèn)題。“樣品是一種有限的資源。因此,任何能改善其管理狀況的方法都是急需的。” Linden 說(shuō),“古代 DNA 研究是一個(gè)快速發(fā)展的領(lǐng)域。它令人興奮,但需要多一些呵護(hù),少一些政治。

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