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【實驗?zāi)康摹?nbsp;
1、掌握蛋白質(zhì)序列檢索的操作方法;
2、熟悉蛋白質(zhì)基本性質(zhì)分析;
3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白質(zhì)功能預(yù)測,了解基于motif、 結(jié)構(gòu)位點、結(jié)構(gòu)功能域數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)功能預(yù)測;
4、了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。
【實驗內(nèi)容】
1、使用Entrez或SRS信息查詢系統(tǒng)檢索人脂聯(lián)素 (ADIponectin)蛋白質(zhì)序列;
2、使用BioEdit軟件對上述蛋白質(zhì)序列進行分子質(zhì)量、氨基酸組成、和疏水性等基本性質(zhì)分析;
3、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行基于ncbi/Blast軟件的蛋白質(zhì)同源性分析;
4、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行motif結(jié)構(gòu)分析;
5、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行二級結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)預(yù)測。
【實驗方法】
1、人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列的檢索:
(1)調(diào)用Internet瀏覽器并在其地址欄輸入Entrez;
(2)在Search后的選擇欄中選擇protein;
(3)在輸入欄輸入homo sapiens adiponectin;
(4)點擊go后顯示序列接受號及序列名稱;
(5)點擊序列接受號NP_004788 (adiponectin precursor; adipose most abundant gene transcript 1
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