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技術(shù)文章

反轉(zhuǎn)錄病毒原液檢測實驗

閱讀:280發(fā)布時間:2015-5-15

通過藥物抗性的水平傳播分析
實驗材料    病毒細胞
試劑、試劑盒    polybrene小牛血清DMEM
儀器、耗材    培養(yǎng)皿濾膜
實驗步驟    
1.  在開始分析的前1天,按1:50將NIH 3T3細胞分傳于3個6 cm 培養(yǎng)皿中。將1個培養(yǎng)皿標記為陽性對照,1個為陰性對照,1個用于待測病毒原液。

2.  含有選擇標記的待測病毒的制備:加0.01 ml 800 μg/ml polybrene至1 ml 待測病毒上清中,通過0.45 μm 濾器過濾。
 
3.  含有選擇標記的陽對照的制備:制備1 ml 無輔助病毒的病毒原液與10~100 CFU輔助病毒原液的混合液。加0.01 ml 800 μg/ml polybrene,通過0.45 μm 濾器過濾除菌。
 
4.   陰性對照病毒原液的制備:制備1 ml 無輔助病毒的病毒原液,加0.01 ml 800 μg/ml polybrene,通過0.45 μm濾器過濾除菌。
 
5.  用各病毒原液感染培養(yǎng)皿上的細胞。將感染后的3個培養(yǎng)皿置于37℃ CO2培養(yǎng)箱中溫育1~3 h以利于吸收,加4 ml DMEM-10培養(yǎng)至細胞匯片。
 
6.  將細胞按1:50分傳于新的6 cm 培養(yǎng)皿中。3個培養(yǎng)皿中每個僅傳一個培養(yǎng)皿,棄去原來感染的細胞的無用的部分。使polybrene的終濃度在2 μg/ml 培養(yǎng)至細胞長到50%~90%匯片。

7.  棄去培養(yǎng)液換以半量的新鮮DMEM-10。再培養(yǎng)2~3天。
 
8.  收獲生長匯片的細胞的zui終的上清。經(jīng)0.45 μm 濾膜過濾,加polybrene至終濃度8 μg/ml。保存于-70℃~ -80℃,或立即用于滴定及分析標記抗性。

9.  在上清滴定前1夭,將新鮮的未經(jīng)感染的NIH 3T3細胞按1:10或1:20分傳于3個6 cm  培養(yǎng)皿中。用各種上清1 ml 感染口NIH 3T3細胞,并進行滴定的各步操作。如果出現(xiàn)了幾千個neo抗性的克隆就說明原始的待測病毒原液中污染了輔助病毒。

反轉(zhuǎn)錄酶分析法

實驗材料    病毒
試劑、試劑盒    SSC乙醇
儀器、耗材    滴定板濾紙離心機
實驗步驟    
1.  加50 μl RT反應混合物于96-孔微量滴定板的各孔中。每個待測或?qū)φ諛悠氛家豢住<?0 μl 病毒上淸,蓋上平板,置于37℃培養(yǎng)箱中溫育1~2 h。

2.  將各反應液10 μl 點于一張2.5 cm 直徑的圓形DE52或DE81濾紙上,其上蓋一張塑料薄膜用2號鉛筆做標記。
 
3.  將濾紙置于一個盤中,加2XSSC覆蓋。室溫下在搖床上輕輕搖動冼滌20 min 棄去SSC重復洗滌步驟2次。在95%乙醇中浸泡1 min,空氣中晾干約10 min。

4.  在閃爍計數(shù)儀中計數(shù)或用感光片曝光。

在Tris-Tricine緩沖系統(tǒng)中電泳

實驗材料    蛋白質(zhì)
試劑、試劑盒    Tricine樣品緩沖液考馬斯亮藍染色液乙酸
儀器、耗材    電泳儀離心機
實驗步驟    
1.  按“Laemmli凝膠電泳法"的步驟1~7,配制溶液并灌制分離膠和積層膠。
 
2.  制備樣品,但采用2×Tricine的樣品緩沖液,加樣前樣品于40℃處理30?60 -11。多肽分子量標準混合物用作多肽分離的對照。

3.  組裝電源裝置并加樣。但加樣孔是以Tricine陰極緩沖液或水加以沖洗并以之充滿;在電泳裝置的下緩沖液槽加入陽極緩沖液,上緩沖液槽加入陰極緩沖液。

4.  連接電源,在30 V 恒壓下電泳1 h 后,接著在150 V 恒壓下電泳4 h。使用熱交換裝置使電泳緩沖液槽溫度維持室溫水平。

5.  當考馬斯亮藍G-250示蹤染料到達凝膠的底部時,將電壓調(diào)回零并斷開電源。

6.  取出凝膠,在考馬斯亮藍G-250染色液中染色2 h,接著在10%乙酸水溶液中脫色,每隔30 min 換液1次,直至背景干凈為止,需要更高檢測敏感度時,推薦采用銀染的方法。


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