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維生素B2的主要生理功用是作為輔酶促進代謝。核黃素和磷酸及一分子蛋白質結合成為黃素酶。這一類酶又叫脫氫酶，重要的是要非常介導的氫原子轉移對糖、脂和氨基酸的代謝都很重要。它是許多動物和微生物生長的必需因素。
維生素B2與特定的蛋白質結合生成黃酶。黃酶在物質代謝中起傳遞氫的作用，參與組織的呼吸過程。
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