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酶切可以:(1)獲得粘性末端進(jìn)行連接;(2)用于驗(yàn)證DNA重組是否成功;(3)用于驗(yàn)證質(zhì)粒酶切位點(diǎn)是否有效。
實(shí)驗(yàn)方法
酶切
實(shí)驗(yàn)方法原理 采用粘末端連接必須對(duì)目的DNA分子和載體分子進(jìn)行酶切以獲得相應(yīng)的粘末端進(jìn)行連接。酶切可以是單酶切也可以是雙酶切。單酶切操作比較簡(jiǎn)單,但雙酶切如果兩種酶所用緩沖液成分不同(主要是鹽離子濃度不同)或反應(yīng)溫度不同,這時(shí)可以采用如下措施解決:1)先用一種酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一種酶切;2)*行低鹽要求的酶酶切,然后添加鹽離子濃度到高鹽的酶反應(yīng)要求,加入第二種酶進(jìn)行酶切;3)使用通用緩沖液進(jìn)行雙酶切。具體要根據(jù)酶的反應(yīng)要求進(jìn)行,盡量避免星號(hào)活力。
實(shí)驗(yàn)材料 質(zhì)粒DNA
試劑、試劑盒 限制性核酸內(nèi)切酶蒸餾水
儀器、耗材 微量移液槍離心機(jī)電泳儀水浴鍋?zhàn)贤馔干溆^測(cè)儀離心管記號(hào)筆
實(shí)驗(yàn)步驟
一、實(shí)驗(yàn)材料準(zhǔn)備
1. 材料:質(zhì)粒DNA。
2. 試劑:限制性內(nèi)切酶、ddH2O。
3 . 儀器:微量移液槍,離心機(jī),水浴鍋, 電泳儀,紫外透射觀測(cè)儀。
二、單酶切
1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:
(1)質(zhì)粒DNA:X μL(約1 μg)。
(2)限制性內(nèi)切酶:1 μL(約10 U)。
(3)10×buffer:2 μL。
(4)ddH2O:補(bǔ)足20 μL。
2. 混勻,做好標(biāo)記。
3. 37℃水浴1-3 h。
4. 70℃水浴10 min中止反應(yīng)。
5. 電泳檢測(cè)酶切效果。
三、雙酶切
1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:
(1)質(zhì)粒DNA:X μL(約1 μg)。
(2)限制性內(nèi)切酶1:1 μL(約10 U)。
(3)限制性內(nèi)切酶2:1 μL(約10 U)
(3)10×buffer:1或2 μL。
(4)ddH2O:補(bǔ)足20 μL。
2. 混勻,做好標(biāo)記。
3. 37℃水浴1-3 h。
4. 70℃水浴10 min中止反應(yīng)。
5. 電泳檢測(cè)酶切效果。
四、結(jié)果與分析
假若一種酶在環(huán)狀質(zhì)粒DNA中只有一個(gè)酶切位點(diǎn), 且酶切*,紫外燈下檢測(cè)電泳結(jié)果,則單酶切應(yīng)為一條帶, 而雙酶切則為兩條帶。如果條帶數(shù)目多于理論值,那么有可能是酶切不*。如果酶切結(jié)果與酶切前的質(zhì)粒條帶一樣(超螺旋、線性和開環(huán)三條帶),則說(shuō)明質(zhì)粒*沒(méi)有被切開。
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注意事項(xiàng)
1. 酶切的選擇原則一般是盡量擴(kuò)大酶切體系,這樣抑制因素得以稀釋;基因組DNA或質(zhì)粒DNA酶的用量較一般DNA大,一般為1μg/10U;所加酶的體積不能超過(guò)酶切總體積的1/10,否則甘油濃度會(huì)超過(guò)5%,會(huì)產(chǎn)生星號(hào)活力;對(duì)難切的質(zhì)?;蚧蚪MDNA應(yīng)延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間4―5hr, 甚至。滅活限制性內(nèi)切酶活性可以采用加熱滅活,乙醇沉淀,酚/氯仿抽提,添加EDTA或SDS等方法,具體每一種酶可能有些方法不能*滅活,這一點(diǎn)需要注意。
2. 雙酶切體系緩沖液添加量要根據(jù)兩種限制性內(nèi)切酶*緩沖體系,可以登錄限制性內(nèi)切酶購(gòu)買公司查看。
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