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閱讀:277發(fā)布時(shí)間:2015-3-20
研究小組確定了富集在小鼠造血干細(xì)胞(HSCs)中的159個(gè)未注釋lncRNA(LncHSCs),其中兩個(gè)lncRNA的敲除可影響HSC的自我更新和分化。
造血干細(xì)胞(HSCs)具有*的基因表達(dá)程序,可執(zhí)行干細(xì)胞的身份確定和調(diào)節(jié)細(xì)胞譜系定型。長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNAs)已經(jīng)成為基因表達(dá)和細(xì)胞命運(yùn)決定的重要調(diào)節(jié)因子,然而它們?cè)谠煅杉?xì)胞中的功能尚不清楚。
在這項(xiàng)研究中,研究人員通過(guò)深度測(cè)序描述了純化造血干細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組,并鑒定了323個(gè)未加注釋的lncRNAs。通過(guò)在已分化的細(xì)胞譜系中比較它們的表達(dá),發(fā)現(xiàn)有159個(gè)lncRNAs富集在造血干細(xì)胞中,其中一些可能是HSC特異性的(lnchscs)。這些lncRNA基因與蛋白編碼基因具有相同的表觀遺傳特征,包括通過(guò)DNA甲基化調(diào)控表達(dá),敲除掉兩個(gè)lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2,對(duì)HSC自我更新和譜系決定具有不同的影響。
該研究小組找出了其中一個(gè)候選lncRNA的基因組結(jié)合位點(diǎn),并發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵造血轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的富集,特別是E2A??偠灾?,這些結(jié)果表明,lncRNAs對(duì)調(diào)節(jié)造血干細(xì)胞起著重要的作用,從而為控制HSC功能的遺傳通路提供了更多的層面。
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