我國(guó)桑蠶大規(guī)模基因組重測(cè)序完成

日前，由深圳華大基因研究院與西南大學(xué)合作的研究成果《40個(gè)基因組的重測(cè)序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關(guān)基因》在學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》上發(fā)表，這是兩家單位自2003年以來(lái)在家蠶基因組研究領(lǐng)域取得的又一項(xiàng)重要成果。

據(jù)悉，這項(xiàng)研究共獲得40個(gè)家蠶突變品系和中國(guó)野桑蠶的全基因組序列，是多細(xì)胞真核生物大規(guī)模重測(cè)序研究的報(bào)道，共獲得632.5億對(duì)堿基序列，覆蓋了99.8%的基因組區(qū)域;繪制完成了世界上*張基因組水平上的蠶類單堿基遺傳變異圖譜，是世界上報(bào)道的昆蟲(chóng)基因組變異圖;從全基因組水平上揭示了家蠶的起源進(jìn)化;發(fā)現(xiàn)了馴化對(duì)家蠶生物學(xué)影響的基因組印記。

華大基因的專家表示，桑蠶大規(guī)?；蚪M重測(cè)序和遺傳變異圖譜構(gòu)建的完成，有助于從全基因組范圍研究馴化和人工選擇對(duì)家蠶生物學(xué)的影響，闡釋家蠶及野桑蠶之間生物學(xué)差異的遺傳基礎(chǔ)。更為重要的是，與野桑蠶相比，家蠶具有更優(yōu)良的經(jīng)濟(jì)性狀，本研究所發(fā)現(xiàn)的全基因組選擇印記，特別是那些受到強(qiáng)烈選擇的具體基因，對(duì)家蠶重要優(yōu)勢(shì)經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)基因克隆及其形成機(jī)理的研究至關(guān)重要。

在不到兩個(gè)月的時(shí)間里，研究團(tuán)隊(duì)即完成了該項(xiàng)目的全部實(shí)驗(yàn)和測(cè)序工作。海量數(shù)據(jù)產(chǎn)出之后，深圳華大基因研究院自主搭建的超算中心及自主開(kāi)發(fā)的生物信息軟件發(fā)揮了重要作用，利用超大規(guī)模計(jì)算能力，研究團(tuán)隊(duì)完成了龐大的數(shù)據(jù)處理，迅速完成了數(shù)據(jù)分析和成果發(fā)表。而本次研究的40個(gè)代表性的家蠶和中國(guó)野桑蠶品系全部來(lái)自于西南大學(xué)蠶學(xué)與基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。

團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人表示，該計(jì)劃后續(xù)所有的目標(biāo)都將集中在“發(fā)現(xiàn)基因、研究基因和利用基因”上，利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)制作的新型蠶品種和相關(guān)產(chǎn)品將于近期進(jìn)入人們的視野。