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上海哈靈生物科技有限公司

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細(xì)菌DNA損傷彗星熒光檢測試劑盒產(chǎn)品說明書

2022-8-2  閱讀(247)

主要用途

 

細(xì)菌DNA損傷彗星(Comet)熒光檢測試劑是一種旨在采用細(xì)菌細(xì)胞中性凝膠電泳,在電場環(huán)境下,損傷變性的DNA片段遷移形成特定的形態(tài),即DNA移動尾巴,來進(jìn)行體外評價(jià)和半定量分析DNA損傷程度的而經(jīng)典的技術(shù)方法。該技術(shù)經(jīng)過精心研制、成功實(shí)驗(yàn)證明的。其適用于新鮮細(xì)菌細(xì)胞的DNA損傷研究,包括DNA鏈斷裂、氧化性堿基損傷、DNA剪切損傷、DNA交聯(lián)、DNA修復(fù)等,應(yīng)用于環(huán)境和藥物毒理學(xué)、放射學(xué)、氧化應(yīng)急反應(yīng)、抗生素敏感性等研究。產(chǎn)品嚴(yán)格無菌,即到即用,性能穩(wěn)定,操作簡便,重復(fù)一致。

 

技術(shù)背景

 

彗星檢測技術(shù)Comet assay),又稱為單細(xì)胞凝膠電泳檢測技術(shù)(single cell gel electrophoresis assaySCGE)或微凝膠電泳檢測技術(shù)(microgel electrophoresis assay),是基于變性切離的DNA片段,在電場的影響下,從細(xì)胞中移出的原理,而完整的超螺旋DNA仍然保持在細(xì)胞核內(nèi)。通過凝膠電泳,呈現(xiàn)出分子遷移圖形,形成彗星拖尾(comet tail)現(xiàn)象,即完整DNA的細(xì)胞染色體為",而松散和斷裂的DNA",以此評價(jià)DNA損傷程度。這是分析單一細(xì)胞DNA鏈斷裂的敏感方法之一。其技術(shù)方法的基本步驟是:第一,細(xì)胞固定包埋在凝膠里;第二,細(xì)胞裂解處理;第三,DNA變性處理;第四,電泳遷移;第五,染色和圖像分析。由此觀察DNA遷移形態(tài),進(jìn)行體外檢測,成為細(xì)胞DNA損傷研究的基本手段。

 

產(chǎn)品內(nèi)容

 

膠體液(Reagent A           3毫升

基質(zhì)液(Reagent B          10毫升

酶解液(Reagent C             500微升

裂解液(Reagent D             200毫升

解構(gòu)液(Reagent E             200毫升

電泳液(Reagent F             用戶自備

中和液(Reagent G                 用戶自備

染色液(Reagent H           1毫升

產(chǎn)品說明書               1

 

保存方式

 

保存酶解液(Reagent C)和染色液(Reagent H)在-20冰箱里,避免光照;膠體液(Reagent A基質(zhì)液(Reagent B室溫下保存;其余的保存在4冰箱里;解構(gòu)液(Reagent E具有腐蝕性,注意操作安全;有效保證6

 

用戶自備

 

無離子水:用于稀釋電泳緩沖液

電泳液(Reagent F):用于電泳的緩沖液(配方見注意事項(xiàng)8

中和液(Reagent G):用于電泳后凝膠清洗(配方見注意事項(xiàng)9

磨砂載玻片和蓋玻片:用于放置樣品進(jìn)行微凝膠電泳的器材

恒溫培養(yǎng)箱:用于孵育反應(yīng)

電泳槽:用于微凝膠電泳的裝置

1.5毫升離心管:用于混勻基質(zhì)液的容器

90 mm細(xì)菌培養(yǎng)皿:用于樣品處理、染色等的容器

熒光顯微鏡:用于觀察細(xì)胞彗星現(xiàn)象

 

實(shí)驗(yàn)步驟

 

一、 瓊脂載玻片準(zhǔn)備

 

1. 準(zhǔn)備1張*磨砂載玻片,磨砂面朝上

2. 膠體液(Reagent A置于微波爐里加熱溶化(注意:避免溢出或干枯;參見注意事項(xiàng)4  

3. 放進(jìn)45℃恒溫水槽孵育10分鐘

4. 移出100微升膠體液(Reagent A到載玻片中間

5. 蓋上潔凈的蓋玻片

6. 輕壓蓋玻片5分鐘,確保膠體液鋪展

7. 放進(jìn)4℃冰箱里直至膠體充分凝結(jié)

 

二、 細(xì)胞準(zhǔn)備

 

實(shí)驗(yàn)開始前,將基質(zhì)液(Reagent B置于微波爐里加熱溶化(注意:參見注意事項(xiàng)4,然后放進(jìn)45℃恒溫水槽備用。然后進(jìn)行下列操作。

 

1. 準(zhǔn)備1管待測的新鮮培養(yǎng)細(xì)菌細(xì)胞 (2 X 106細(xì)菌/毫升)

2. 移出20微升菌液到1.5毫升離心管

3. 加入180微升在45℃恒溫水槽里的基質(zhì)液(Reagent B

4. 用槍頭上下抽吸混勻

5. 用大拇指推動移走上述制備的載玻片上的蓋玻片

6. 即刻移取75微升細(xì)菌基質(zhì)混合液到載玻片膠體上

7. 用新的蓋玻片蓋上

8. 輕壓蓋玻片5分鐘,確保細(xì)菌基質(zhì)混合液鋪展

9. 放進(jìn)4℃冰箱里冷卻10分鐘,直至膠體凝結(jié),避免光照

10. 移出20微升室溫預(yù)熱的酶解液(Reagent C1.5毫升離心管

11. 加入180微升在45℃恒溫水槽里的基質(zhì)液(Reagent B

12. 用槍頭上下抽吸混勻

13. 用大拇指推動移走上述制備的載玻片上的蓋玻片

14. 即刻移取200微升酶解基質(zhì)混合液到載玻片樣品上面

15. 用新的蓋玻片蓋上

16. 輕壓蓋玻片5分鐘,確保酶解基質(zhì)混合液鋪展

17. 37℃溫度下孵育30分鐘,避免光照(注意:同時確保膠體凝結(jié)

18. 再次用大拇指推動移走蓋玻片

19. 將載玻片放進(jìn)9cm細(xì)菌培養(yǎng)皿

20. 加入10毫升4℃預(yù)冷的裂解液(Reagent D

21. 放進(jìn)4℃冰箱里孵育60分鐘

22. 抽去裂解液

23. 加入10解構(gòu)液(Reagent E

24. 室溫下孵育30分鐘,避免光照

25. 小心抽去解構(gòu)液

 

三、 凝膠電泳

 

1. 移出25毫升用戶自備的電泳液(Reagent F250毫升三角燒瓶里

2. 加入225毫升用戶自備的無離子水,充分混勻后,標(biāo)記為電泳工作液

3. 加入10毫升電泳工作液到上述9cm細(xì)菌培養(yǎng)皿

4. 室溫下孵育5分鐘

5. 倒去電泳工作液

6. 重復(fù)實(shí)驗(yàn)步驟35一次

7. 將載玻片置于(具有溫度控制的)水平電泳槽里

8. 加入適量的電泳工作液到電泳槽里,恰好在載玻片之上

9. 插上電源,設(shè)定電壓為12伏或電壓1.5/厘米(根據(jù)電泳槽正負(fù)電極的距離)

10. 4℃環(huán)境下,電泳30分鐘(注意:可以延長時間,最大限度顯示拖尾現(xiàn)象)

11. 斷開電源,取出載玻片

12. 放進(jìn)9cm細(xì)菌培養(yǎng)皿

13. 加入10毫升用戶自備的中和液(Reagent G

14. 4℃冰箱里孵育5分鐘

15. 倒去中和液

16. 空氣中晾干

 

四、 染色分析

 

1. 加上50微升染色液(Reagent H

2. 蓋上新的蓋玻片

3. 室溫下孵育15分鐘,避免光照

4. 即刻在熒光顯微鏡油鏡下觀察并拍照記錄:激發(fā)波長480nm;散發(fā)波長610nm或紫外波長激發(fā)

5. 室溫下避光保存,如果重新觀察,可以重復(fù)實(shí)驗(yàn)步驟14

6. 分析參數(shù):

1) 形態(tài)指標(biāo),即拖尾率目測計(jì)量(comet%)。根據(jù)熒光圖像是否象彗星一樣頭尾分明將其分為彗星樣細(xì)胞和非彗星樣細(xì)胞,計(jì)數(shù)一定量細(xì)胞中彗星樣細(xì)胞所占的比例,即彗星樣細(xì)胞發(fā)生率(comet%),估計(jì) DNA 的損傷程度。通過鏡下觀察,計(jì)數(shù)500個細(xì)胞,直接得到,方便實(shí)用。

 

2) 距離指標(biāo),即直接在顯微鏡下或在照片上測出彗星的一些長度數(shù)值。

(1) 尾長(Tail Length;µm):沿電泳方向尾部最遠(yuǎn)端與頭部中心間的距離(遷移距離)――距離越長,DNA損傷越嚴(yán)重

(2) 總彗星長度(comet lengthµm):從頭至尾,電泳方向上的最大長度――長度越大,DNA損傷越嚴(yán)重

(3) 尾長與頭部直徑比值:沿電泳方向尾部最遠(yuǎn)端與頭部中心間的距離與頭部直徑之比――比值越大,DNA損傷越嚴(yán)重

 

3) 強(qiáng)度指標(biāo),即DNA含量

(1) 頭部和尾部熒光百分比:尾部總熒光強(qiáng)度與頭部總熒光強(qiáng)度的比值――百分比越高,DNA損傷越嚴(yán)重

(2) 尾部和總彗星熒光百分比(Tail DNA%): 檢測500個細(xì)胞

 

等級

Tail DNA

DNA損傷程度

0

< 5

無損傷

1

520

輕度

2

2040

中度

3

4095

重度

4

> 95

*

 

4) 矩類指標(biāo),構(gòu)建距離、強(qiáng)度的平均關(guān)系數(shù)值

(1) 尾矩(tail moment;TM),又稱為Olive tail momentOTM):尾部 DNA 占總 DNA 的百分比與頭、尾部中心間距的乘積,單位為µm%µm tail fraction

(2) 彗星矩(comet momentCM):以頭部中心點(diǎn)為零點(diǎn),沿電泳方向?qū)㈠缧前匆欢ǖ拈g隔分成若干個區(qū)域(80個),分別測定每個區(qū)域的熒光強(qiáng)度乘以該區(qū)域中心距零點(diǎn)的距離除以彗星總熒光強(qiáng)度

 

7. 構(gòu)建DNA損傷程度和藥物處理劑量(dose)或時間(time)曲線

 

注意事項(xiàng)

 

1. 本產(chǎn)品為20次操作

2. 操作時須戴手套

3. 整個操作,建議在暗光下進(jìn)行

4. 膠體液(Reagent A基質(zhì)液(Reagent B微波爐加熱融化時,松開瓶蓋,低功率,且密切觀察,防止過度加熱,導(dǎo)致溢出或干枯

5. 建議使用新鮮培養(yǎng)的細(xì)菌細(xì)胞

6. 如果細(xì)菌的鞭毛功能較強(qiáng),或細(xì)胞壁難以裂解,建議使用細(xì)菌細(xì)胞彗星實(shí)驗(yàn)預(yù)處理試劑盒-10082.3

7. 可以使用100微摩爾/過氧化氫或25微摩爾/冰上孵育10分鐘預(yù)處理樣品作為陽性對照

8. 操作時小心輕柔,避免膠體脫位

9. 電泳溫度過高,會造成膠體脫位

10. 電泳液(Reagent F):10TBE

11. 中和液(Reagent G):70%乙醇

12. 電泳時,根據(jù)用戶所使用的電泳槽的電極兩端實(shí)際距離,按照1.5/厘米確定電壓強(qiáng)度

13. 細(xì)菌DNA損傷彗星圖像如下


 

14. 由于細(xì)菌染色體只有1條,閉環(huán)DNA鏈,3000左右kb,彗星尾巴形態(tài)常為線條狀或彌散狀

15. 本公司提供系列DNA損傷檢測分析試劑產(chǎn)品

 

質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)

1. 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定性能穩(wěn)定

2. 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定重復(fù)性好




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