Applied Biosystems Axiom 蘋果基因分型陣列是我們 Axiom 農(nóng)業(yè)基因組學(xué)基因分型解決方案的組成部分，其所含的靶標(biāo)基因組 DNA 均在 GeneTitan 多通道儀器上制備和處理。該自動化過程包括將 gDNA 與該高通量微陣列雜交，然后進(jìn)行染色、洗滌、成像和輸出基因分型數(shù)據(jù)以供進(jìn)一步分析。
Axiom 蘋果基因分型陣列有48,139個蘋果屬 SNP。該陣列是與 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他國際合作伙伴合作設(shè)計的。該陣列使用一個先前進(jìn)行基因分型的不同品種組合以及一個野生蘋果屬種質(zhì)組合進(jìn)行設(shè)計。
該陣列的設(shè)計包括以下內(nèi)容：
? 向后兼容的一組 SNP（7,711個），這些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 陣列和 Applied Biosystems Axiom 480K 陣列上準(zhǔn)確、可靠地聚類
? 采用單倍型塊策略使每 125 kB 中一個 10 kB 窗口包含8個 SNP，均勻覆蓋 HFTH1 全基因組序列
? 針對重要性狀的經(jīng)驗證 SNP
? 專門針對蘋果屬山荊子、西府海棠、東方莢果蕨、八枝海棠、新疆野蘋果和歐洲野生蘋果的 SNP
? 用于檢測 S 等位基因的一組 SNP
該陣列還具有 384HT 規(guī)格。
所需產(chǎn)品
GeneChip Commａnd Console 軟件
GeneTitan 多通道儀器
Axiom Analysis Suite 軟件
Axiom 長格式導(dǎo)出工具 (AxLE)
Axiom 蘋果基因分型陣列有48,139個蘋果屬 SNP。該陣列是與 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他國際合作伙伴合作設(shè)計的。該陣列使用一個先前進(jìn)行基因分型的不同品種組合以及一個野生蘋果屬種質(zhì)組合進(jìn)行設(shè)計。
該陣列的設(shè)計包括以下內(nèi)容：
? 向后兼容的一組 SNP（7,711個），這些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 陣列和 Applied Biosystems Axiom 480K 陣列上準(zhǔn)確、可靠地聚類
? 采用單倍型塊策略使每 125 kB 中一個 10 kB 窗口包含8個 SNP，均勻覆蓋 HFTH1 全基因組序列
? 針對重要性狀的經(jīng)驗證 SNP
? 專門針對蘋果屬山荊子、西府海棠、東方莢果蕨、八枝海棠、新疆野蘋果和歐洲野生蘋果的 SNP
? 用于檢測 S 等位基因的一組 SNP
該陣列還具有 384HT 規(guī)格。
所需產(chǎn)品
GeneChip Commａnd Console 軟件
GeneTitan 多通道儀器
Axiom Analysis Suite 軟件
Axiom 長格式導(dǎo)出工具 (AxLE)
